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标题: packmol输出文件.pbd怎么加力场并转化为LAMMPS可读取的date文件呢？ [打印本页]

作者
Author: 落微 时间: 2022-3-3 21:38
标题: packmol输出文件.pbd怎么加力场并转化为LAMMPS可读取的date文件呢？
各位老师好，我看到有位老师16年发过的一个回答：“先用guassian 输出一个分子的.pdb文件，其中有成键情况，再用packmol利用guassian生成的一个分子的.pdb建模，然后用moltemplate写入立场文件输出data文件”
请问我现在已经用Gaussview建立了分子文件，并用packmol建立了.pbd文件，请问下一步力场文件怎么写入，并转化为LAMMPS可读入的date文件呢呢？

作者
Author: 水仙球 时间: 2022-5-23 01:24
同问，vmd导出的data文件里有原子类型，没有参数

，不知道angle-coeffs怎么写

作者
Author: Chang2021 时间: 2022-6-24 14:47
这得看要写入哪种力场参数吧。如果写入moltemplate直接支持的OPLS-AA的话，直接写个lt脚本就行吧。

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