计算化学公社

标题: 安装好了gimic 2.0,但是计算出错 [打印本页]

作者
Author: ACS_Nano 时间: 2022-3-3 21:42
标题: 安装好了gimic 2.0,但是计算出错
sob老师好，我按照您的帖子《考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用》安装了GIMIC2.0。在虚拟机里安装的CentOS 7.6系统，用root账户严格按照您的每一步操作，可是安装好了，在计算时出了问题。
按照您的帖子，test.inp, XDENS和MOL文件都得到了，可是运行gimic test.inp |tee gimic.out之后，就出错了。
Python也没有重新安装，可是好像是python哪儿有问题了，您能帮忙看看怎么解决吗？谢谢了。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-3 22:20
也许是Python版本兼容性问题
使用和我博文相同的系统

作者
Author: ACS_Nano 时间: 2022-3-3 22:41

sobereva 发表于 2022-3-3 22:20
也许是Python版本兼容性问题
使用和我博文相同的系统

谢谢sob老师回复，我就是用的和博文里面相同的系统，还是这个问题。您知道怎么处理这个兼容性问题吗，谢谢了。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-3 22:46

ACS_Nano 发表于 2022-3-3 22:41
谢谢sob老师回复，我就是用的和博文里面相同的系统，还是这个问题。您知道怎么处理这个兼容性问题吗，谢 ...

你自己重新装了Python
博文里系统自带的Python根本不是3.9

作者
Author: ACS_Nano 时间: 2022-3-3 22:58

sobereva 发表于 2022-3-3 22:46
你自己重新装了Python
博文里系统自带的Python根本不是3.9

我是严格按照您博文里面操作的，确实没有单独安装过，难道您博文里面有涉及到python的安装吗，好像也没有，奇怪了。
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
博文部分内容如下：
在系统里依次运行以下命令，安装EPEL源，并且装上cmake和conda。GIMIC 2.0是用Fortran和Python混合写的，所以需要安装conda来管理Python的包。
yum install epel-release
yum install cmake
yum install conda

然后运行下面的命令创建一个名为myconda的环境，并且初始化conda
conda create --name myconda
conda init bash
在~/.bashrc文件的末尾加入一行conda activate myconda使得每次进入终端后自动激活myconda环境。

退出终端，然后重新进入终端，输入以下命令安装GIMIC 2.0运行时依赖的一些Python库
conda install cython numpy pyparsing

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-3 23:03

ACS_Nano 发表于 2022-3-3 22:58
我是严格按照您博文里面操作的，确实没有单独安装过，难道您博文里面有涉及到python的安装吗，好像也没有 ...

博文的安装是基于完全干净的CentOS 7.6写的，所有细节都交代了，没有什么可补充的

作者
Author: ACS_Nano 时间: 2022-3-3 23:51

sobereva 发表于 2022-3-3 23:03
博文的安装是基于完全干净的CentOS 7.6写的，所有细节都交代了，没有什么可补充的

谢谢sob老师了，我又看了一遍，DVD iso镜像都没问题，各个选项也没问题，自己也没安装python，就成了3.9版本了。算了，搞不明白了。

作者
Author: radical 时间: 2022-4-24 11:05

ACS_Nano 发表于 2022-3-3 23:51
谢谢sob老师了，我又看了一遍，DVD iso镜像都没问题，各个选项也没问题，自己也没安装python，就成了3.9 ...

你好，请问你的问题·有解决吗，我遇到了相同的情况，不过我的python是3.1
(, 下载次数 Times of downloads: 26)

作者
Author: kimariyb 时间: 2023-5-21 01:07
我也有相同的情况发生，不知道楼主的解决办法是什么

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