计算化学公社

标题: 用Gaussian View怎么构建复杂分子以及高斯运算报错问题 [打印本页]

作者
Author: xinyanli 时间: 2022-3-4 11:19
标题: 用Gaussian View怎么构建复杂分子以及高斯运算报错问题
我是量化计算的小白，有如下这些问题想请教老师们：1.想用Gaussian计算，但是构建分子上存在难题。想问下GaussianView能构建复杂的分子吗？今天试了一下GV，但实在是感觉不太好用。或者老师们有没有推荐的构建分子的软件呢？现在高斯输入文件的分子结构部分不能很好构建的话，感觉后面很难进行。
2.想请问一下运行高斯案例里面的文件时，高斯出现如下错误是为什么？（已检查out文件，文件大概在说明计算方法后就突然结束，显示的内容和正常输出文件没有差别）

作者
Author: zjxitcc 时间: 2022-3-4 11:28
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-3-4 11:31 编辑

GaussView可以构建不少复杂分子，自带模板和功能已经挺强大了。如果你不熟悉GV的使用，且分子比较大的话，可以参考《借助ChemDraw和Chem3D构建大分子模型》。

至于你的报错，Windows下所有Gaussian报错在屏幕上都会显示2070，这是没有意义的报错信息，所以你贴这个，别人也是帮不了你的。还是要看输出文件末尾有啥信息。如果你看不出、或末尾实在没有报错信息，那就换到Linux系统下算，减少奇怪的报错。丝毫不用担心自己不会安装Linux系统，Win10自带WSL（Ubuntu子系统），网上安装教程有一箩筐，装完以后在里面安装Linux g16，再提交计算任务。

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2022-3-4 12:26
本帖最后由北大-陶豫于 2022-3-4 12:27 编辑

关于你的第一个问题，我比较喜欢在chem3D里画结构（也可以在chemdraw里画好然后粘到chem3D，但粘的时候手性等信息可能出错，需要检查一下），然后保存为gjf格式。

第二个问题请看：
在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... id=57&fromuid=19420
Gaussian 常见报错及解决方法；新手求助报错时的注意事项
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =4829&fromuid=19420

作者
Author: xinyanli 时间: 2022-3-4 14:40

北大-陶豫发表于 2022-3-4 12:26
关于你的第一个问题，我比较喜欢在chem3D里画结构（也可以在chemdraw里画好然后粘到chem3D，但粘的时候手性 ...

好的，谢谢您。

作者
Author: xinyanli 时间: 2022-3-4 14:42

zjxitcc 发表于 2022-3-4 11:28
GaussView可以构建不少复杂分子，自带模板和功能已经挺强大了。如果你不熟悉GV的使用，且分子比较大的话， ...

好的，明白。谢谢你

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-4 18:22
1 那叫GaussView
不好用是因为你不会用
GaussView是构建分子模型最好用的工具（除非体系带有大量并环，或者有特别长的链，此时适合chemdraw+chem3D产生初始结构），没有之一
你要是参加过一次北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html），照着演示好好练练自然就会明白这点
其它程序诸如Chem3D、M$、Avogadro、Gabedit等等在建模方面都比这差远了

2
(, 下载次数 Times of downloads: 10)

作者
Author: xinyanli 时间: 2022-3-4 18:54

sobereva 发表于 2022-3-4 18:22
1 那叫GaussView
不好用是因为你不会用
GaussView是构建分子模型最好用的工具（除非体系带有大量并环，或 ...

明白，谢谢老师啦，我会继续学习的。

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