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标题: 在MCPB.py -i XX.in -s 2中遇到力常数问题 [打印本页]

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ananbaby2309    时间: 2022-3-7 05:49
标题: 在MCPB.py -i XX.in -s 2中遇到力常数问题
Amber初学者,在处理Fe配合物过程中,Amber总是出现如图的报错,但检查fchk文件,发现force constant部分并无异常。fchk压缩文件太大无法上传,上传了压缩的log文件。希望各位老师能帮忙指点一二。非常感谢!
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晨晨晨嘛    时间: 5 day ago
您好!请问您解决这个问题了嘛

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student0618    时间: 4 day ago
我沒看楼主的文件,不过以前用MCPB.py时发现有些AmberTools17能跑的任务换AmberTools21就报错了。不知换版本能否解决。

btw 最近找到个说是比mcpb更flexible的工具easyParm (github https://github.com/Abdelazim-Abdelgawwad/easyPARM.git,文章 https://doi.org/10.1063/5.0301038) ,没时间试试但看上去自带的教程算是完善的。或许可以试试。




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