计算化学公社

标题: 求助吡啶阳离子的N上接不同取代基时的电荷分布问题 [打印本页]

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Author: xiaobai1 时间: 2022-3-7 20:10
标题: 求助吡啶阳离子的N上接不同取代基时的电荷分布问题
最近在做吡啶阳离子的上N接不同取代基的电荷分布情况，按理说碳链越长给电子能力越强，N上的电荷应该更小，但是用乙基和丙基上去的时候发现接乙基的吡啶N上电荷更小，看文献有提到会是二面角的原因，但自己也一知半解的，有没有大神知道是什么情况

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Author: sobereva 时间: 2022-3-7 22:06
先把当前计算级别和计算原子电荷的方法说清楚
看《原子电荷计算方法的对比》（http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml）了解不同原子电荷计算方法的差异

作者
Author: xiaobai1 时间: 2022-3-8 08:38

sobereva 发表于 2022-3-7 22:06
先把当前计算级别和计算原子电荷的方法说清楚
看《原子电荷计算方法的对比》（http://www.whxb.pku.edu.cn ...

sob老师我是先在b3lyp/6-31++(d,p) scrf=(smd,solvent=water) em=gd3bj 下先对结构进行了优化；
然后用mk方法计算的电荷，这是我计算电荷用的# b3lyp/6-31++(d,p) scrf=(smd,solvent=water) pop=mk em=gd3bj iop(6/42=6)，体系带一个正电荷；
还有sob老师我看网上说gaussian默认用的是Mulliken方法计算的电荷，但是我看结构优化的输出文件中的电荷分布与我第二步用mk方法算的电荷分布一致，也不知道是哪里出了问题

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Author: sobereva 时间: 2022-3-8 09:05

xiaobai1 发表于 2022-3-8 08:38
sob老师我是先在b3lyp/6-31++(d,p) scrf=(smd,solvent=water) em=gd3bj 下先对结构进行了优化；
然后用m ...

两种电荷都输出，取哪个自己决定
带弥散函数时候Mulliken电荷没有任何意义，前述的《原子电荷计算方法的对比》一文已经明确说了

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Author: xiaobai1 时间: 2022-3-8 10:08

sobereva 发表于 2022-3-8 09:05
两种电荷都输出，取哪个自己决定
带弥散函数时候Mulliken电荷没有任何意义，前述的《原子电荷计算方法的 ...

但是sob老师，我用mk和mulliken算出来的电荷，跟碳链越长给电子能力越强这一结论相违背了，3个碳的N上电荷反而高，我试了把弥散函数去掉，但是计算出来N上电荷变负值了

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Author: sobereva 时间: 2022-3-9 05:15

xiaobai1 发表于 2022-3-8 10:08
但是sob老师，我用mk和mulliken算出来的电荷，跟碳链越长给电子能力越强这一结论相违背了，3个碳的N上电 ...

N的原子电荷为负再正常不过，本来电负性就比周围的碳要大

“碳链越长给电子能力越强”这种说法并非什么时候都适用

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