计算化学公社

标题: intel oneAPI以及vasp5.4.4安装 [打印本页]

作者
Author: shadow 时间: 2022-3-8 21:11
标题: intel oneAPI以及vasp5.4.4安装
本帖最后由 shadow 于 2022-3-8 21:43 编辑

一、编译器安装
Intel oneAPI 的工具包都开源免费，官网即可下载https://www.intel.cn/content/www ... kits.html#gs.j2pglr
下载Base Toolkit和HPC Toolkit后：
1. 赋予下载的文件执行权限
      chmod +x l_BaseKit_p_2021.4.0.3422_offline.sh
      chmod +x l_HPCKit_p_2021.4.0.3347_offline.sh
2. 安装
      ./l_BaseKit_p_2021.4.0.3422_offline.sh
      ./l_HPCKit_p_2021.4.0.3347_offline.sh
      安装完成后将显示安装目录，root账户在/opt/intel/oneAPI下，普通用户在家目录下，修改安装目录把安装完后的整个目录移动到相应目录即可
3. 添加环境变量
      vi /etc/bashrc
      里面加入一行：source /opt/intel/oneapi/setvars.sh intel64       #intel64: Generate code and use libraries for Intel® 64 architecture-based targets. 此处也可临时生效一次为后续编译vasp做准备

二、VASP 5.4.4 安装
1. 解压安装包
      tar -zxvf vasp.5.4.4.tar.gz
2. 把arch/makefile.include.linux_intel拷到上一级目录下改名为makefile.include，里面的配置专门适合Intel编译器
      cp makefile.include.linux_intel /opt/vasp.5.4.4/makefile.include
3. 打开此文件，把其中的OFLAG参数里加入-xhost
      vi makefile.include             #增添-xhost参数可以使ifort编译出的程序能够利用当前机子CPU支持的最高档次SIMD指令集
            OFLAG    = -O2 -xhost
4. 编译
      make all
5. 可选项
      可以把最常用的vasp_std改名为vasp
6. 设置环境变量
      export PATH=$PATH:/opt/vasp.5.4.4/bin
7. 试运行
      mpirun -np 4 vasp_std INCAR             #若修改了vasp_std为vasp，此处应修改为 mpirun -np 4 vasp INCAR

三、备注
      系统存在多个openmpi时，为避免冲突，应将$PATH路径设置一下，只使其中一个生效。Intel oneAPI中包括了一个openmpi。

四、参考
编译器:    https://blog.csdn.net/qq_40180414/article/details/114540317
编译器:    https://www.intel.com/content/ww ... ler-components.html
VASP:       https://yxli8023.github.io/2020/08/09/VASP-install.html
VASP:       http://sobereva.com/455

作者
Author: FHN 时间: 2022-5-18 09:41
本帖最后由 FHN 于 2022-5-18 09:44 编辑

大佬你好我在centos7（非虚拟机）装intel oneAPI时出现不能联网的提示但是我的网络是正常的求解答万分感谢

作者
Author: shadow 时间: 2022-5-18 16:59

FHN 发表于 2022-5-18 09:41
大佬你好我在centos7（非虚拟机）装intel oneAPI时出现不能联网的提示但是我的网络是正常的求解答万 ...

原因或许为你选择的是online版本，应该选择offline版本

作者
Author: FHN 时间: 2022-5-18 19:54

shadow 发表于 2022-5-18 16:59
原因或许为你选择的是online版本，应该选择offline版本

我用offline离线安装还是会在第四步提示不能联网这就离谱不知道咋办了求解答

作者
Author: shadow 时间: 2022-5-18 20:55
本帖最后由 shadow 于 2022-5-18 21:01 编辑

FHN 发表于 2022-5-18 19:54
我用offline离线安装还是会在第四步提示不能联网这就离谱不知道咋办了求解答

按理来说离线安装不需要网络的，这我也不知道咋回事，看图片你下载的版本好像选择的是online版本，或许可以下载offline版本再试着安装一次

作者
Author: FHN 时间: 2022-5-18 22:26

shadow 发表于 2022-5-18 20:55
按理来说离线安装不需要网络的，这我也不知道咋回事，看图片你下载的版本好像选择的是online版本，或许可 ...

我这个图是online的但是我下寨过offline的安装过也出现这个问题了

作者
Author: hitvip 时间: 2022-7-22 12:11
不用编译 fftw3xf 了吗?

作者
Author: wang5360848 时间: 2022-9-10 15:47
感谢楼主，这一套好用！

作者
Author: 这是神马事 时间: 2023-11-5 12:19
本帖最后由这是神马事于 2023-11-5 12:41 编辑

提醒一下，oneapi如果用在amd CPU上，不要加-xhost，容易出varpro错误

作者
Author: _Fun 时间: 2024-5-16 10:46
老师你好，oneapi下没有setvars.sh脚本，可能是什么原因导致的？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)