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标题: 求助:电场下含阴离子表面活性剂的油滴迁移问题 [打印本页]

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qzupc    时间: 2022-3-9 11:02
标题: 求助:电场下含阴离子表面活性剂的油滴迁移问题
各位老师好,我最近在用gromacs做电场下含有阴离子表面活性剂SDS的油滴迁移模拟,周围是水分子,如果只使用周期性边界条件现象是正常的,我想体现出在电极上的沉积和润湿现象,就在左侧加了一个Au原子组成的平板,md过程将平板冻结目的用于挡住液滴,但现在跑完md之后左液滴正常沉积了,右液滴迁移到一定距离之后不继续向左迁移(中间没有真空层),请问这是什么原因呢,谢谢各位老师!图一是没加金属板的情况,图二是加金属板的情况 (, 下载次数 Times of downloads: 23) (, 下载次数 Times of downloads: 39) ,尝试过在左右两侧都加Au原子平板和z方向加wall,但是效果都不理想,希望各位老师帮忙解答一下,非常感谢!


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sobereva    时间: 2022-3-9 22:04
也许是静电作用达到了平衡,导致电场没法给右侧液滴驱动力继续往左移动
本身左边已经沉积的部分有很多带负电荷的磺酸基了,会对右边液滴的磺酸基有静电互斥。而且左边的钠离子都整体跑到右边去了,静电吸引也导致表面带负电的右边液滴不容易继续往左移动。
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qzupc    时间: 2022-3-10 10:12
sobereva 发表于 2022-3-9 22:04
也许是静电作用达到了平衡,导致电场没法给右侧液滴驱动力继续往左移动
本身左边已经沉积的部分有很多带负 ...

谢谢社长的回复,我理解了您的意思,但是一开始是左右液滴的迁移和变形趋势是一致的,大概到了左液滴沉积稳定的时候右液滴就好像“不受电场力作用了”,这是不是左边加的Au平板太厚了屏蔽了一定的电场?我设置的是12×80×80埃的,盒子尺寸是240×80×80埃的
另外我试过加wall的命令,结果md之后盒子一直体积不稳定,而且加了很低的电场强度液滴就破碎了,这和不加wall的情况差别很大,社长您有什么好的建议吗,谢谢
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sobereva    时间: 2022-3-10 21:58
qzupc 发表于 2022-3-10 10:12
谢谢社长的回复,我理解了您的意思,但是一开始是左右液滴的迁移和变形趋势是一致的,大概到了左液滴沉积 ...

Au板不会屏蔽电场
每个原子感受到的外加电场都是相同的
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qzupc    时间: 2022-3-10 23:13
sobereva 发表于 2022-3-10 21:58
Au板不会屏蔽电场
每个原子感受到的外加电场都是相同的

那为什么不加板的时候两个液滴就会正常迁移变形也不会平衡呢?是因为可以一直沿x方向周期性边界条件穿过去吗,我有考虑过把盒子x方向设的很大,但那样最多只是出现左右液滴变形后“首尾相连”,不会模拟出沉积、聚结这种现象,社长您有什么好的建议吗?非常感谢您百忙之中抽空回复




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