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标题: GRO文件中某些原子超出周期性边界，导致分子破裂，请问如何得到正确的分子坐标 [打印本页]

作者
Author: iuhgnor 时间: 2022-3-12 10:17
标题: GRO文件中某些原子超出周期性边界，导致分子破裂，请问如何得到正确的分子坐标
各位老师好，我拿到一个GRO文件，某些原子超出周期性边界，被划定到另一个单元中，导致分子破裂，请问有什么方便的方法可以“修正”GRO文件、得到正确的分子坐标吗？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-13 07:33
用gmx trjconv转换gro文件，带上-pbc mol保持分子完整

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