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标题: 求助关于使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图时的单位 [打印本页]

作者
Author:
19896216650    时间: 2022-3-12 22:27
标题: 求助关于使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图时的单位
本帖最后由 19896216650 于 2022-3-12 22:30 编辑

使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图,
Multiwfn导出的vtx1.pdb文件的前两行为:

REMARK   Generated by Multiwfn, totally     86774 surface vertices
REMARK   Unit of B-factor field (i.e. ESP) is eV
静电势单位为 eV
Multiwfn导出的vtx2.pdb,
vtx3.pdb
文件的前两行为:
REMARK   Generated by Multiwfn, totally     32186 surface vertices
REMARK   Unit of B-factor field (i.e. ESP) is kcal/mol
静电势单位为 kcal/mol

VMD Main中经查看
Graphics - Representation的Trajectory
标签页文本框里

(, 下载次数 Times of downloads: 7)

请问此处单位被统一为kcal/mol了吗?










作者
Author:
sobereva    时间: 2022-3-13 06:59
没有统一
这个文本框并没有对应任何单位,VMD并不知道你载入的.pdb文件里B因子是什么单位,VMD只是从pdb里载入数值而已

用iso命令绘制就不用管单位的事,Multiwfn给的静电势cub文件里记录的值总是原子单位

作者
Author:
19896216650    时间: 2022-3-13 09:51
好嘞  谢谢sob老师

那是不是绘制范德华穿透图时可以不标注color scale bar呢?




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