计算化学公社
标题:
求助关于使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图时的单位
[打印本页]
作者Author:
19896216650
时间:
2022-3-12 22:27
标题:
求助关于使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图时的单位
本帖最后由 19896216650 于 2022-3-12 22:30 编辑
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图,
Multiwfn导出
的vtx1.pdb文件的前两行为:
REMARK Generated by Multiwfn, totally 86774 surface vertices
REMARK Unit of B-factor field (i.e. ESP) is eV
静电势单位为
eV
Multiwfn导出
的vtx2.pdb,
vtx3.pdb
文件的前两行为:
REMARK Generated by Multiwfn, totally 32186 surface vertices
REMARK Unit of B-factor field (i.e. ESP) is kcal/mol
静电势单位为
kcal/mol
VMD Main中经查看
Graphics - Representation的Trajectory
标签页文本框里
(, 下载次数 Times of downloads: 7)
上传 Uploaded
点击下载Click to download
请问此处单位被统一为
kcal/mol了吗?
作者Author:
sobereva
时间:
2022-3-13 06:59
没有统一
这个文本框并没有对应任何单位,VMD并不知道你载入的.pdb文件里B因子是什么单位,VMD只是从pdb里载入数值而已
用iso命令绘制就不用管单位的事,Multiwfn给的静电势cub文件里记录的值总是原子单位
作者Author:
19896216650
时间:
2022-3-13 09:51
好嘞 谢谢sob老师
那是不是绘制范德华穿透图时可以不标注color scale bar呢?
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3