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标题: 求助-关于gromacs进行频谱解析 [打印本页]

作者
Author: wenshang956 时间: 2022-3-12 23:17
标题: 求助-关于gromacs进行频谱解析
想尝试使用gromacs模拟外加电场体系，不清楚如何进行相关的频谱分析（傅里叶变化）呀？想请教gromacs有没有相应的分析指令，或是其他较为方便的分析软件或方法，还是说需要自己编程处理？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-13 07:02
VMD的Extensions - Analysis里直接有IR Spectra density calculator
用这个前必须把原子电荷先载入VMD

作者
Author: wenshang956 时间: 2022-3-13 13:11

sobereva 发表于 2022-3-13 07:02
VMD的Extensions - Analysis里直接有IR Spectra density calculator
用这个前必须把原子电荷先载入VMD

请问sob老师，这个可以得到光谱强度和频率的关系曲线吗？我尝试了一下，好像只做出了光谱密度的图像，我的设置应该没问题吧

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