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标题: 关于CP2K 固定原子坐标后还会移动的疑问 [打印本页]

作者
Author: 柚柚紫 时间: 2022-3-16 09:17
标题: 关于CP2K 固定原子坐标后还会移动的疑问
各位老师好。
最近遇到一个问题。在inp里输入了FIXED_ATOMS 关键词。
用来限制部分原子的位移。但是计算完发现固定的原子
也有0.3埃左右的移动。不知道老师们又遇到这种情况吗？
如何才能原子坐标也不动呢？
感谢各位老师！

作者
Author: 丁越 时间: 2022-3-16 10:47
输入文件没啥问题啊，你检查下你想固定的那部分原子序号是不是已经在FIXED_ATOMS里面了
拿gview再选一遍原子序号

作者
Author: 柚柚紫 时间: 2022-3-16 14:43

丁越发表于 2022-3-16 10:47
输入文件没啥问题啊，你检查下你想固定的那部分原子序号是不是已经在FIXED_ATOMS里面了
拿gview再选一遍原 ...

感谢您的回复！这个坐标确实是选上了。结构输出的pos.xyz中第一帧开始固定的原子就不动了。只不过第一帧开始固定的原子坐标已经变化了。我看官网上讲这个FIXED ATOMS只是固定了分数坐标，
实空间坐标并未固定。但是这俩如果晶格常数不变的话应该是一一对应的关系。并且我算的其他算例，
不同的结构同样的设置。有的没问题，有的有问题。比较迷惑。。。

作者
Author: nusiew 时间: 2022-3-31 15:16

柚柚紫发表于 2022-3-16 14:43
感谢您的回复！这个坐标确实是选上了。结构输出的pos.xyz中第一帧开始固定的原子就不动了。只不过第一帧 ...

您好，请问该问题解决了吗？

作者
Author: 柚柚紫 时间: 2022-4-9 21:37

nusiew 发表于 2022-3-31 15:16
您好，请问该问题解决了吗？

动还是在动，应该是结构格式的问题。用cif比较好。

作者
Author: learn-GAUSSIAN 时间: 2023-12-24 13:52

柚柚紫发表于 2022-3-16 14:43
感谢您的回复！这个坐标确实是选上了。结构输出的pos.xyz中第一帧开始固定的原子就不动了。只不过第一帧 ...

你好，我在做NPT时也遇到了这种问题，请问实空间坐标应该如何固定呢

作者
Author: Yhang 时间: 2024-4-7 15:22

learn-GAUSSIAN 发表于 2023-12-24 13:52
你好，我在做NPT时也遇到了这种问题，请问实空间坐标应该如何固定呢

你好，那你解决这个问题吗？我最近也遇到相同的问题的

作者
Author: longyp 时间: 2024-4-9 23:31
我也遇到相同的问题了，求助

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