计算化学公社

标题: Gaussian的ONIOM可以模拟溶剂粘度对反应的影响吗？ [打印本页]

作者
Author: wangzhe 时间: 2022-3-16 09:53
标题: Gaussian的ONIOM可以模拟溶剂粘度对反应的影响吗？
打算模拟几个不同粘度溶液中的反应能垒，我打算用显式溶剂模型，把大量溶剂分子放在ONIOM的外层，再加以隐式溶剂模型。不知这样做能否模拟出溶剂粘性对反应的影响？还是说必须要用MD才可以模拟？谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-16 16:14
必须用MD
静态计算没法体现粘度对物质运动的影响

作者
Author: wangzhe 时间: 2022-3-16 16:21

sobereva 发表于 2022-3-16 17:14
必须用MD
静态计算没法体现粘度对物质运动的影响

谢谢老师回复。如果想要模拟反应能垒（过渡态）的话是需要用AIMD吗？

作者
Author: tjuptz 时间: 2022-3-16 21:41
感觉粘度对反应的影响是动力学层面的事

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-3-17 00:06

wangzhe 发表于 2022-3-16 09:21
谢谢老师回复。如果想要模拟反应能垒（过渡态）的话是需要用AIMD吗？

如果是扩散控制的反应，只需要用粘度计算扩散系数，再用扩散系数按https://en.wikipedia.org/wiki/Diffusion-controlled_reaction计算速率常数就行了。这个计算需要知道分子半径，按http://sobereva.com/190的方法计算，此外需要本征反应速率kr，一般按过渡态理论计算就行了，如果需要精度高一些可以考虑隧穿。
如果不是扩散控制的反应，粘度对反应速率的影响一般可以忽略。因为实验上不可能只改变粘度而不改变溶剂的其他性质，可以考虑一下不同溶剂里反应速率的差异是不是粘度以外的因素导致的。

作者
Author: wangzhe 时间: 2022-3-17 08:09

wzkchem5 发表于 2022-3-17 01:06
如果是扩散控制的反应，只需要用粘度计算扩散系数，再用扩散系数按https://en.wikipedia.org/wiki/Diffus ...

感谢详细的回复。我研究的反应应该是扩散控制的反应，我学习一下，谢谢。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)