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标题: 关于进行tleap加氢后原有小分子键断裂的问题请教 [打印本页]

作者
Author: 小李 时间: 2022-3-17 17:01
标题: 关于进行tleap加氢后原有小分子键断裂的问题请教
各位老师前辈大家好，想对于进行tleap加氢后原有小分子键断裂的问题请教gaussain优化后结构，磷（暗金色）和碳链这表的氧连接键长1.7，查到的一般参考p—o键长1.6左右，这时候VMD打开还是连接的

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之后进行tleap排序后就断开了，但键长没有改变。
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如果继续往后操作进行加水箱以及后续的MD操作，在进行到整体最小化后结构便会不对
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请请教一下发生上面情况的原因以及您建议的处理方式。谢谢您

作者
Author: 陈英翾 时间: 2023-5-25 14:04
您好
请问您这个问题解决了吗
我也碰到了这样的问题

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