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标题: 关于反应自由能计算的问题 [打印本页]

作者
Author: ter20 时间: 2016-3-13 11:35
标题: 关于反应自由能计算的问题
遇到一个问题，比如用高斯计算一个A + B -> C 反应的自由能G变化，已经优化得到三者的稳定结构，并通过频率分析得到了三者孤立分子状态下的自由能G(A)，G(B)和G(C)，同时我又计算了A与B距离足够远（比如20 Angstrom）状态下两者构成体系的自由能G(A...........B)，由于自由度不一样，G(A...........B) ≠ G(A) + G(B)，那么我算自由能变化时该用哪个呢？我也不知道正确的做法是什么，以前听说过有相关文献讨论这个问题，现在找不到了，也不好搜关键词，所以在这里求教大家。
另外，如果实验中A和B会先靠近生成一个有弱作用的复合物A---B，其自由能为G(A---B)，那么是不是就该使用G(C) - G(A---B)来计算做反应自由能变化?

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-13 13:07
这种反应应当以G(A)+G(B)作为反应物自由能。
如果会形成稳定的A---B复合物，那么也可以用G(A---B)，这是A---B -> C过程自由能的变化。
以什么状态为参考就取决于自己，以及计算目的了。

作者
Author: ter20 时间: 2016-3-14 09:03

sobereva 发表于 2016-3-13 13:07
这种反应应当以G(A)+G(B)作为反应物自由能。
如果会形成稳定的A---B复合物，那么也可以用G(A---B)，这是A- ...

明白了，感谢Sob!

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