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标题: 求助:请问Amber可以使用两个力场吗? [打印本页]

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xjw    时间: 2022-3-18 19:45
标题: 求助:请问Amber可以使用两个力场吗?
我想做一个溶剂分子和锂盐的混合,利用Gaff力场得到了溶剂分子和锂盐阴离子的文件,但是最后却报错,tleap文件内容和报错信息如下:/home/xjw/software/amber20/bin/teLeap: Error!
For atom (.R<LI 202>.A<LI 1>) could not find vdW (or other) parameters for type (Li+)





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sylar    时间: 2022-3-18 21:54
加上source leaprc.ffPM3试试
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rpestana94    时间: 2022-3-19 05:46
Try with source leaprc.water.fb3, it has Li parameters, you can check the parameters file in the Amber folder: "$AMBERHOME/dat/leap/ " inside there are cmd and parm folder which are parameter files you can use

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xjw    时间: 2022-3-19 08:16
sylar 发表于 2022-3-18 21:54
加上source leaprc.ffPM3试试

谢谢回复,我最后用source leaprc.ff99发现可以用
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xjw    时间: 2022-3-19 08:17
rpestana94 发表于 2022-3-19 05:46
Try with source leaprc.water.fb3, it has Li parameters, you can check the parameters file in the Amb ...

谢谢,我试试。我自己用leaprc.ff99可以使用




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