计算化学公社

标题: 求助GROMAC QMMM计算设置虚拟点出错 [打印本页]

作者
Author: yjb 时间: 2022-3-20 22:25
标题: 求助GROMAC QMMM计算设置虚拟点出错
本人打算试用gromacs+gaussian 跑QM/MM MD模拟蛋白体系，把配体和金属附近的残基侧链归入QM区域，在top文件中设置虚拟点。

丛高斯中取出QM区域的结构，发现Figure1 中只有第一个残基的侧链被H饱和，其余的H都分布在其他的地方并没有饱和QM/MM交接的原子。

Figure2是设置的虚拟点。

求各位老师指点！！！！！

作者
Author: yjb 时间: 2022-3-20 22:33
图不知道为什么上传不上去。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-21 07:35

yjb 发表于 2022-3-20 22:33
图不知道为什么上传不上去。

看置顶的新社员必读贴了解怎么传图

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)