计算化学公社
标题:
有机分子偶极矩计算和ESP分析绘图的耗时问题
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作者Author:
Youzi
时间:
2022-3-21 17:10
标题:
有机分子偶极矩计算和ESP分析绘图的耗时问题
计算对象是单个有机分子,软件:Gaussian09W,cpu:i9-10900x,128G分子的样式如图中所示,体系一般只包含C、H、O、N、S、卤素这些元素,大概在150原子左右
刚开始尝试了6-311G**(看了sob老师文章后发现可能结果不可靠,准备换
def2-SVPD算
),但已经需要1h左右才能得到一个结果;同时参考了sob老师的文章《
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图
》,利用.fch文件在Multiwfn中绘制分子表面静电势图,发现几乎算不动(进度一直在1%)
想请教一下,
1.我的计算方法是否正确(Gaussian输入文件在附件,ESP分析跟随sob老师帖子进行,使用的是Multiwfn3.7);
2.计算耗时是否正常;
3.对于这种体系计算偶极矩以及进行ESP分析是否有效率更高的方法或选择?
作者Author:
sobereva
时间:
2022-3-21 19:02
用那么古老的Multiwfn干嘛
仔细看
巨幅降低Multiwfn结合VMD绘制分子表面静电势图耗时的一个关键技巧
http://sobereva.com/602
(
http://bbs.keinsci.com/thread-23859-1-1.html
)
Multiwfn使用的高效的静电势算法的介绍文章已于PCCP期刊发表!
http://sobereva.com/614
(
http://bbs.keinsci.com/thread-24940-1-1.html
)
最新版对这种任务的耗时和3.7版完全不在一个数量级
用6-311G**没问题
作者Author:
Youzi
时间:
2022-3-21 19:29
sobereva 发表于 2022-3-21 19:02
用那么古老的Multiwfn干嘛
仔细看
巨幅降低Multiwfn结合VMD绘制分子表面静电势图耗时的一个关键技巧
好的!!感谢sob老师,我去试一下
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