计算化学公社
标题:
请问如何在gromacs中选择合适力场替代compass力场下对于超临界CO2和聚合物体系研究
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作者Author:
高处裹棉被
时间:
2022-3-24 15:32
标题:
请问如何在gromacs中选择合适力场替代compass力场下对于超临界CO2和聚合物体系研究
本帖最后由 高处裹棉被 于 2022-3-24 16:35 编辑
各位老师好,我想要采用gromacs模仿一篇采用MS软件在compass力场下,进行超临界CO2在聚合物体系中的溶解扩散行为研究的文献,请问该如何选择合适的力场。
在查阅诸多文献后,已发现采用OPLS-AA和GAFF力场可以对聚合物进行很好的描述,而TraPPE-small适用于描述超临界二氧化碳,请问两个力场能否混用,还是统一采取OPASS-AA或GAFF力场?
如果要混用力场的话请问怎么平均LJ势,我查到混用力场的文献中有写As for cross site-site interactions, we applied the geometric mean mixing rule for both LJ parameters,但具体该怎么操作?
谢谢各位老师
作者Author:
zaqxs234
时间:
2022-3-24 21:17
个人见解:如用混合立场可计算模拟后的密度、溶解度参数等与文献对比,相差不大即可
作者Author:
sobereva
时间:
2022-3-25 08:36
不得不混用。本来GAFF等普通有机分子力场就严重描述不好超临界二氧化碳
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