计算化学公社

标题: 如何使用reaxff计算键能解离过程 [打印本页]

作者
Author: lc123 时间: 2022-3-26 09:37
标题: 如何使用reaxff计算键能解离过程
大家好，最近有看到使用reaxff和DFT做对比计算势能曲线，就是计算出不同键长对应的能量，DFT的话可以通过柔性扫描得到，请教大家如何用reaxff的话应该怎么进行计算呢，类似于下面这张图片所失曲线 (, 下载次数 Times of downloads: 22) 谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-26 14:29
未必做了柔性扫描，也可能只是刚性扫描

如果确实是基于柔性扫描做的，用ReaxFF对其它某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量就完了，怎么做看具体程序

作者
Author: lc123 时间: 2022-3-26 15:29

sobereva 发表于 2022-3-26 14:29
未必做了柔性扫描，也可能只是刚性扫描

如果确实是基于柔性扫描做的，用ReaxFF对其它某个级别的柔性扫描 ...

谢谢老师的解答，但是我对老师您所说的用Reaxff对其他某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量没太理解，老师您的意思是说把柔性扫描的每一帧轨迹视为一个初始结构，然后用reaxff计算这些个结构的能量吗？（老师我用的是lammps里面的reaxff力场，那这些都是在lammps里面计算吗）

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-26 16:39

lc123 发表于 2022-3-26 15:29
谢谢老师的解答，但是我对老师您所说的用Reaxff对其他某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量没太理解，老师 ...

是

作者
Author: mengxiangidea 时间: 2022-3-28 20:36
楼主你好，请问你反应力场参数如何选取的，可以私下请教一些问题吗

作者
Author: lc123 时间: 2022-3-30 20:08

mengxiangidea 发表于 2022-3-28 20:36
楼主你好，请问你反应力场参数如何选取的，可以私下请教一些问题吗

可以的啊，是从别人的文献中引用的

作者
Author: mengxiangidea 时间: 2022-3-31 21:30

lc123 发表于 2022-3-30 20:08
可以的啊，是从别人的文献中引用的

能加qq吗？qq：794398844

作者
Author: mengxiangidea 时间: 2022-3-31 22:34

mengxiangidea 发表于 2022-3-31 21:30
能加qq吗？qq：794398844

我想知道param.qeq文件里面坐标怎么来的

作者
Author: ZZU_SCU 时间: 2022-4-3 21:31

lc123 发表于 2022-3-26 15:29
谢谢老师的解答，但是我对老师您所说的用Reaxff对其他某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量没太理解，老师 ...

您好！我也想做这样的解离曲线，怎么把DFT柔性或者刚性扫描的每一帧保存成trj轨迹文件。lammps怎么写脚本依次识别每一帧呢？

作者
Author: lc123 时间: 2022-4-12 13:51

ZZU_SCU 发表于 2022-4-3 21:31
您好！我也想做这样的解离曲线，怎么把DFT柔性或者刚性扫描的每一帧保存成trj轨迹文件。lammps怎么写脚本 ...

不好意思啊这个lammps脚本怎么写我也不太会，后来我导师没让我继续这方面的研究了，我的理解是把柔性扫描出的每一步结构都单独保存下来，改写成lammps的data文件，然后用lammps分别计算这些结构的能量，但是感觉有点繁琐。

作者
Author: ZZU_SCU 时间: 2022-4-12 15:17

lc123 发表于 2022-4-12 13:51
不好意思啊这个lammps脚本怎么写我也不太会，后来我导师没让我继续这方面的研究了，我的理解是把柔性扫描 ...

谢谢您的回复，我也是这样做的。感觉有些繁琐

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)