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标题: 求助有没有快速输出gmx模拟的最后一帧gro文件的方法 [打印本页]

作者
Author: FrancisLi 时间: 2022-3-28 01:52
标题: 求助有没有快速输出gmx模拟的最后一帧gro文件的方法
各位老师，我经常需要查看gmx跑的怎么样了，所以用gmx trjconv来输出最后一帧，还得进log文件看看最后一帧跑到哪了，感觉每次都这样很浪费时间，想问下有没有什么方便的方法能快速output目前跑到的最后一帧呀，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-28 10:58
最简单的做法，把cpt文件转成gro，用VMD看就完了
虽然cpt不是最新一帧的，但可以自己设cpt多久更新一次

如果必须从轨迹文件里提取，自己写个脚本就完了。利用gmx check查看轨迹文件的信息，并调用trjconv提取最后一帧

作者
Author: FrancisLi 时间: 2022-3-29 02:56

sobereva 发表于 2022-3-28 10:58
最简单的做法，把cpt文件转成gro，用VMD看就完了
虽然cpt不是最新一帧的，但可以自己设cpt多久更新一次

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好的，感谢sob老师！

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