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标题: NCI分析用到的fchk文件相关问题 [打印本页]

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Author: 15whyhq 时间: 2016-3-17 11:48
标题: NCI分析用到的fchk文件相关问题
我用低水平算的三个结构的能垒顺序与加完溶剂效应算出的不一致，能垒最低就是最优路径，然后我想知道NCI分析用的chk文件是用低水平的chk还是加溶剂效应的chk文件相应转换成fchk文件。fchk文件输入到软件中读取的数据与能量有关系吗？

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-3-17 11:50
用低水平的chk与用加完溶剂效应的chk得出的散点图及彩图的结果会不会一样？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-17 11:54
是否考虑溶剂效应会一定程度影响电子密度分布，从而影响RDG分析结果。如果实际中应当是溶剂下的，那就在溶剂下产生fchk文件。

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-3-17 21:52
是否考虑溶剂效应会一定程度影响电子密度分布，从而影响RDG分析结果。这是什么意思？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-17 23:55

15whyhq 发表于 2016-3-17 21:52
是否考虑溶剂效应会一定程度影响电子密度分布，从而影响RDG分析结果。这是什么意思？

用隐式溶剂模型时，极性溶剂会导致体系电子密度被极化，电子密度分布变了自然依赖于它的RDG分析结果也会多少发生些变化，但肉眼不一定容易看出差异

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-3-18 20:40
明白。谢谢老师！

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