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标题: linux系统使用GauMd2xyz程序转换动力学轨迹报错forrtl: severe (24): end-of-file ... [打印本页]

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尘劫    时间: 2022-3-29 15:32
标题: linux系统使用GauMd2xyz程序转换动力学轨迹报错forrtl: severe (24): end-of-file ...
本帖最后由 尘劫 于 2022-3-29 18:41 编辑

我使用gaussian16的ADMP关键字计算结构,然后利用GauMd2xyz转换轨迹格式,我把gaussian的输出文件xyz.out下载到Windows上面使用Windows版本的GauMd2xyz的时候可以转换,但使用linux版本的时候却出现了如下的报错。因为我的结构有点多,而且输出文件也挺大(1g左右),受限于网速,这么多结构从服务器上面下载下来需要耗费的时间挺久的,所以我想请教一下这个问题该如何解决? (, 下载次数 Times of downloads: 8)

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sobereva    时间: 2022-3-29 17:22
直接写xyz.out就完了
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尘劫    时间: 2022-3-29 18:40
sobereva 发表于 2022-3-29 17:22
直接写xyz.out就完了

直接写xyz.out也是这样的报错
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sobereva    时间: 2022-3-31 14:53
输入文件内容有问题,或者版本兼容性问题。没具体文件没法说

另外,Gaussian输出文件是文本文件,压缩的油水巨大,嫌传文件耗时高显然要先压缩

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尘劫    时间: 2022-3-31 20:36
sobereva 发表于 2022-3-31 14:53
输入文件内容有问题,或者版本兼容性问题。没具体文件没法说

另外,Gaussian输出文件是文本文件,压缩的 ...

谢谢社长,之前没想到压缩,这样下载应该能快好多
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PESPES    时间: 2024-9-19 08:41
本帖最后由 PESPES 于 2024-9-19 08:43 编辑
sobereva 发表于 2022-3-29 17:22
直接写xyz.out就完了

请问社长,GauMD2xyz是不是只适合把G09计算的MD结果转化为xyz文件?使用G16计算MD时,用这个程序转化也出现上述的报错提示,使用的方法是MP2方法。
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sobereva    时间: 2024-9-20 04:28
PESPES 发表于 2024-9-19 08:41
请问社长,GauMD2xyz是不是只适合把G09计算的MD结果转化为xyz文件?使用G16计算MD时,用这个程序转化也出 ...

能用于G16
前面说过,没具体文件没法说。GauMD2xyz压缩包里自带的例子文件就是G16跑出来的,怎么可能不适合
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PESPES    时间: 2024-9-23 08:21
sobereva 发表于 2024-9-20 04:28
能用于G16
前面说过,没具体文件没法说。GauMD2xyz压缩包里自带的例子文件就是G16跑出来的,怎么可能不 ...

社长,这是Gaussian跑bomd的输出文件,您看看可以用GauMD2xyz程序转化为xyz文件么?

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sobereva    时间: 2024-9-24 01:29
PESPES 发表于 2024-9-23 08:21
社长,这是Gaussian跑bomd的输出文件,您看看可以用GauMD2xyz程序转化为xyz文件么?

甭用#T。或者载入fch文件
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PESPES    时间: 2024-9-24 08:19
sobereva 发表于 2024-9-24 01:29
甭用#T。或者载入fch文件

谢谢社长,我试试不用#T看看能不能转化




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