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标题: 活化Gibbs自由能小于零应如何处理? [打印本页]

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Synthcat    时间: 2022-3-30 23:33
标题: 活化Gibbs自由能小于零应如何处理?
本帖最后由 Synthcat 于 2022-3-30 23:35 编辑

各位老师,小弟最近再计算一个质子转移反应的过渡态时,结果显示过渡态的能量比反应物-产物复合物能量要低,请问这种情况有什么解释?或者应该如何处理?计算所用的级别:M062X-D3/def2TZVPP//M062X-D3/def2svp,溶剂模型SMD(甲醇)。
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QuantumicGuy    时间: 2022-3-30 23:48
群里看到的,希望能帮到你
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Synthcat    时间: 2022-3-30 23:57
QuantumicGuy 发表于 2022-3-30 23:48
群里看到的,希望能帮到你

非常感谢!我大概明白了,如果遇到这种情况就是说明电子能垒比较小了
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sobereva    时间: 2022-3-31 14:37
对于这种情况,如果想分析得比较细致,建议分别考察:
电子能垒
焓的热校正量对自由能能垒的影响
-T*delta_S对自由能垒的影响
此外,还可以用Shermo进一步分解不同振动模式对自由能热校正量的不同成分的影响。

都分解开,自然就能明白导致自由能垒为负的因素。最常见的情况是:计算不当/弄错了数据,或者电子能垒本来就很小。

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Synthcat    时间: 2022-3-31 18:44
sobereva 发表于 2022-3-31 14:37
对于这种情况,如果想分析得比较细致,建议分别考察:
电子能垒
焓的热校正量对自由能能垒的影响

感谢社长,我去尝试一下
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Synthcat    时间: 2022-3-31 22:16
sobereva 发表于 2022-3-31 14:37
对于这种情况,如果想分析得比较细致,建议分别考察:
电子能垒
焓的热校正量对自由能能垒的影响

社长,抱歉还有一个问题,同样是这个反应,为什么从过渡态到产物的能量变化是正值呢?我检查了一下,应该没有计算错误。
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sobereva    时间: 2022-4-1 00:38
Synthcat 发表于 2022-3-31 22:16
社长,抱歉还有一个问题,同样是这个反应,为什么从过渡态到产物的能量变化是正值呢?我检查了一下,应该 ...

可能当前过渡态不是直接连接这个产物的过渡态,做个IRC进行检验。亦可能优化用的级别和单点级别太悬殊,导致能量顺序定性不符
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北大-陶豫    时间: 2022-4-1 09:53
你从D1到TS为啥凭空冒出一个氢来?
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喵星大佬    时间: 2022-4-1 10:09
北大-陶豫 发表于 2022-4-1 09:53
你从D1到TS为啥凭空冒出一个氢来?

应该是画错了
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Synthcat    时间: 2022-4-1 16:31
北大-陶豫 发表于 2022-4-1 09:53
你从D1到TS为啥凭空冒出一个氢来?

这个是chemdraw自动变了,我建模没有错
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Synthcat    时间: 2022-4-1 16:32
sobereva 发表于 2022-4-1 00:38
可能当前过渡态不是直接连接这个产物的过渡态,做个IRC进行检验。亦可能优化用的级别和单点级别太悬殊, ...

好的,感谢社长




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