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标题: GROMACS分析时RDF未出现很长收敛区，数据可以用吗？ [打印本页]

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Author: 蕊蕊花儿杰杰 时间: 2022-4-1 08:56
标题: GROMACS分析时RDF未出现很长收敛区，数据可以用吗？
大家好：
我在计算两个O原子间的RDF，出现这样的情况，最后是到了1，但没有出现很长的收敛区间，这个数据可以用吗？谢谢~

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-1 14:24
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

体系都不说清楚

作者
Author: 蕊蕊花儿杰杰 时间: 2022-4-1 20:34

sobereva 发表于 2022-4-1 14:24
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

抱歉。体系是环糊精、水、醇。跑了60nsnpt，6nm的盒子。

作者
Author: 蕊蕊花儿杰杰 时间: 2022-4-1 20:35

蕊蕊花儿杰杰发表于 2022-4-1 20:34
抱歉。体系是环糊精、水、醇。跑了60nsnpt，6nm的盒子。

计算的是环糊精羟基上的氧和醇羟基上的氧。非常感谢老师~

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-2 00:11
如果操作正确，没必然问题
也可以用更大盒子，看到了3nm之后部分是否平滑收敛到1

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