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标题: 通过Forcite对石墨烯/有机物做限制性剪切,动力学平衡时化学键变的很长如何解决? [打印本页]

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张张包    时间: 2022-4-2 15:59
标题: 通过Forcite对石墨烯/有机物做限制性剪切,动力学平衡时化学键变的很长如何解决?
       各位老师,我想通过限制性剪切来模拟复合材料摩擦过程。发现动力学平衡后键变得很长,左图是我的操作步骤,右图是笔记本模拟的小体系,也出现了同样的问题。我觉得可能是第一步出了错误,但目前没想到解决办法,另外想请大家看看有没有可能是其他问题,或者模拟过程是否有不合理之处,请大家赐教,谢谢。

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zyj19831206    时间: 2022-4-3 09:39
是不是中间体系没有退火?
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AaronO_o    时间: 2022-4-3 10:53
个人认为应当首先检查该部分(及其它所有部分)几何结构是否合理,如是否出现多余/丢失原子(复制粘贴结构时容易出现)、错误连接原子(自动成键时容易出现)等问题;
随后参考Forcite->Calculate->Energy下Forcefield右侧More中力场描述,在运算后的模型中检查是否符合该部分所有原子应有的力场类型(自动分配力场类型可能不合适),并检查电荷分配是否有明显的不合理(这一点可能并非主要影响因素)。

此外检查报表中,无定义的力场类型这一项也能有所帮助,用于判断这一C-O价键的立场类型是否合理。

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张张包    时间: 2022-4-10 22:27
zyj19831206 发表于 2022-4-3 09:39
是不是中间体系没有退火?

退火了 NVT NPT都做了2ns
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张张包    时间: 2022-4-10 22:31
AaronO_o 发表于 2022-4-3 10:53
个人认为应当首先检查该部分(及其它所有部分)几何结构是否合理,如是否出现多余/丢失原子(复制粘贴结构 ...

好的 谢谢您的回复,获益良多。目前已经解决问题了,再次感谢!




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