计算化学公社

标题: 请问能否通过gaussian研究分子的亲水性和疏水性？ [打印本页]

作者
Author: UTM 时间: 2022-4-2 22:05
标题: 请问能否通过gaussian研究分子的亲水性和疏水性？
如题，比如羰基、氨基、羟基等是亲水基团，长碳链、苯环是疏水基团，油脂分子有亲水端和疏水端。是否可以通过量子化学的方法定量描述分子某一片段的亲水性和疏水性？

作者
Author: UTM 时间: 2022-4-2 22:07
读过sob老师的帖子知道可以使用油水分配系数LogP来判定整个分子的亲水性，但不知道能否判定分子的一部分的亲水性。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-2 22:17
参考MPI指数。通常MPI越大越亲水
谈谈如何衡量分子的极性
http://sobereva.com/518（http://bbs.keinsci.com/thread-14971-1-1.html）

Multiwfn的定量分子表面分析功能可以对特定片段做表面静电势分析（包括输出MPI指数）从而衡量。按下文，主功能12做表面静电势分析后，在后处理菜单选12，输入片段里包含的原子的序号
使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
http://sobereva.com/159

作者
Author: UTM 时间: 2022-4-2 22:30

sobereva 发表于 2022-4-2 22:17
参考MPI指数。通常MPI越大越亲水
谈谈如何衡量分子的极性
http://sobereva.com/518（http://bbs.keinsci. ...

谢谢sob老师，请问使用gaussian可以算吗？没有使用过Multiwfn.......

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-2 22:59

UTM 发表于 2022-4-2 22:30
谢谢sob老师，请问使用gaussian可以算吗？没有使用过Multiwfn.......

不能算
你的学习能力为0么？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-4-2 23:14

UTM 发表于 2022-4-2 15:30
谢谢sob老师，请问使用gaussian可以算吗？没有使用过Multiwfn.......

你第一次用origin之前你也不会用origin，难道就用excel画图凑合了吗？
而且那还是excel能画图的情况下，你都学会了origin，现在遇到gaussian完全不能做的事情，叫你学Multiwfn倒不学，为啥？

作者
Author: slope 时间: 2022-4-5 10:04

UTM 发表于 2022-4-2 22:30
谢谢sob老师，请问使用gaussian可以算吗？没有使用过Multiwfn.......

看社长帖子，顶多几十分钟就学得会

作者
Author: ChemG 时间: 2022-4-5 14:26

sobereva 发表于 2022-4-2 22:17
参考MPI指数。通常MPI越大越亲水
谈谈如何衡量分子的极性
http://sobereva.com/518（http://bbs.keinsci. ...

请问社长，分子的亲疏水性可以用溶解自由能衡量吗

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-5 21:32

ChemG 发表于 2022-4-5 14:26
请问社长，分子的亲疏水性可以用溶解自由能衡量吗

光靠这个不行，不同尺寸分子没有可比性，比如聚合物，10个单元和200个单元，数量级肯定不同。而MPI在分母里有体系总表面积，就没这个问题。

作者
Author: ChemG 时间: 2022-4-6 12:56

sobereva 发表于 2022-4-5 21:32
光靠这个不行，不同尺寸分子没有可比性，比如聚合物，10个单元和200个单元，数量级肯定不同。而MPI在分母 ...

懂了，谢谢社长

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)