计算化学公社
标题:
vmd显示蛋白质问题
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作者Author:
mol
时间:
2022-4-4 06:10
标题:
vmd显示蛋白质问题
诸位前辈好,小弟最近在研究蛋白质在界面上的吸附问题,在用vmd1.9.3打算对蛋白质采用newcartoon方式显示并根据二级结构着色的过程中,发现如下报错:
File C:\Users\dell\AppData\Local\Temp\2 has too many atoms in residue TDM 0
Error reading PDB file C:\Users\dell\AppData\Local\Temp\2
ERROR) Unable to find Stride output file: C:\Users\dell\AppData\Local\Temp\3
ERROR) Stride::read_stride_record: unable to read output file from Stride
ERROR) Call to Stride program failed.
大概是认为我的衬底TDM上原子太多(167个),但是我试了试另外一种衬底I7U的结构(191个原子),一切显示正常,不知问题在何处?
以下是两者pdb文件截图,小弟拜谢。
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作者Author:
乐平
时间:
2022-4-4 11:21
为什么不直接上传报错的 pdb 文件呢……
截个片段的图根本看不出问题啊……
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