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标题: 弱相互作用中RDG面颜色相近问题 [打印本页]

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-18 22:23
标题: 弱相互作用中RDG面颜色相近问题
本帖最后由 lianghua飘于 2016-3-18 22:27 编辑

请教：
团簇体系中，有很多水分子与正负离子（M+,-），其中H与负离子M-之间的区域颜色，O与正离子（M+）之间的区域颜色相近，无法区分哪一个作用更强，如果想区别开来，有什么方法呢？
（调整了scaleminmax还是不行）
谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-19 00:37
用Multiwfn做AIM分析，比较相应的键临界点的电子密度（越大越强）、势能密度（越负越强）

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-19 09:32

sobereva 发表于 2016-3-19 00:37
用Multiwfn做AIM分析，比较相应的键临界点的电子密度（越大越强）、势能密度（越负越强）

多谢sob

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-20 17:50

sobereva 发表于 2016-3-19 00:37
用Multiwfn做AIM分析，比较相应的键临界点的电子密度（越大越强）、势能密度（越负越强）

sob您好，再请教一下：
1.电子密度、势能密度的单位取什么？
2.Multiwfn作的电子密度、势能密度数值一般取到小数点后几位合适，比如0.12677E-01与0.12589E-01这两个值是否可以近似相等？
3.团簇体系（K2I2(H2O)3-）中，多个H原子与I原子作用，多个O原子与K原子作用，如果要对比分析H-I与O-K的作用强弱，是否应该把所有的H-I之间键临界点的电子密度加和，把所有的O-K之间键临界点的电子密度加和，然后比较大小？
谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-20 18:17

lianghua飘发表于 2016-3-20 17:50
sob您好，再请教一下：
1.电子密度、势能密度的单位取什么？
2.Multiwfn作的电子密度、势能密度数值一 ...

1 a.u.
2 不算近似相等。你这个是科学计数法，没法说小数点后的位数，只能说有效位数。保留的有效位数至少4位，应该能体现不同体系的差异
3 不是同一类相互作用（元素不一样），这么比没有意义

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-20 19:54
本帖最后由 lianghua飘于 2016-3-20 21:07 编辑

sobereva 发表于 2016-3-20 18:17
1 a.u.
2 不算近似相等。你这个是科学计数法，没法说小数点后的位数，只能说有效位数。保留的有效位数 ...

sob您好：
关于第三个问题，还有疑问：
1.我想知道H-I之间的相互作用与O-K之间的相互作用谁强谁弱，通过键临界点的电子密度、势能密度，不能比吗？
（这个思想还是您在我前面的问题给出的啊）
2.同一个水分子的两个氢原子与相邻的两个I原子作用，O原子与一个K原子作用，
每能否把两个氢原子与相邻两个I原子的作用相加，来判断H与I相互作用的强弱？
谢谢!

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-20 22:18

lianghua飘发表于 2016-3-20 19:54
sob您好：
关于第三个问题，还有疑问：
1.我想知道H-I之间的相互作用与O-K之间的相互作用谁强谁弱，通过 ...

1 我历来说的都是对种类相互作用才能这么比。不是同类的只能算相互作用能比较
2 算相互作用能直接就能体现总强度

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-20 22:28
本帖最后由 lianghua飘于 2016-3-21 10:37 编辑

sobereva 发表于 2016-3-20 22:18
1 我历来说的都是对种类相互作用才能这么比。不是同类的只能算相互作用能比较
2 算相互作用能直接就能 ...

sob您好，再请教：
我想算团簇体系K2I2(H2O)3-中：H与I的相互作用能，O与K的相互作用能，这个具体怎么操作呢？
谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-21 11:53

lianghua飘发表于 2016-3-20 22:28
sob您好，再请教：
我想算团簇体系K2I2(H2O)3-中：H与I的相互作用能，O与K的相互作用能，这个具体怎么操作 ...

总能量和两个片段能量相减。片段怎么划分才能直接体现这两类相互作用能，视体系具体结构而定。

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-21 20:04

sobereva 发表于 2016-3-21 11:53
总能量和两个片段能量相减。片段怎么划分才能直接体现这两类相互作用能，视体系具体结构而定。

sob您好，
我作的体系是负离子团簇K2I2(H2O)3-，结构图如附件所示，我想比较H-I之间的作用与O-K之间的作用大小，
这个可以怎么划分片段呢？
谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-21 23:41

lianghua飘发表于 2016-3-21 20:04
sob您好，
我作的体系是负离子团簇K2I2(H2O)3-，结构图如附件所示，我想比较H-I之间的作用与O-K之间的作 ...

这个没法严格计算相互作用能，因为是相互耦合的
至于个别的，比如K2与O的相互作用能，就计算整体与K2原子以及其余部分的能量差值

作者
Author: lianghua飘 时间: 2016-3-22 09:09
Sob您好，这个问题也持续了好几遍了，还是没能解决问题，我就想比较一下H-I之间、O-K之间的作用强弱，临界点电子密度不行、相互作用能不行、RDG颜色相近，那应该用什么方法呢，图在附件里，谢谢

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