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标题: 新手求助,使用Multiwfn脚本结合ORCA进行RESP计算的问题 [打印本页]

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Niohe    时间: 2022-4-11 08:53
标题: 新手求助,使用Multiwfn脚本结合ORCA进行RESP计算的问题

网上找的Amber的教程多数都是使用Gaussian得到的out文件然后使用antechamber命令得到一个resp电荷的mol2文件。

antechamber -i ligand.out -fi gout -c resp -o ligand_resp.mol2 -fo mol2 -pf y

那么使用Multiwfn脚本通过ORCA计算得到的RESP电荷,是不是只要复制到mol2文件中对应位置得到resp的mol2文件就可以直接进行下一步生成输入文件frcmod文件导入到体系中去了?
谢谢

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z9527567    时间: 2022-4-11 09:02
我感觉是的,其实也不用复制粘贴,用Multiwfn保存为pqr格式,然后openbabel转一下mol2就好了,复制粘贴怪麻烦的
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Niohe    时间: 2022-4-11 10:53
谢谢,就是看到mol2的文件头好像有电荷描述的部分,担心直接黏贴的情况会有什么不可知的影响。
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sobereva    时间: 2022-4-11 19:01
Niohe 发表于 2022-4-11 10:53
谢谢,就是看到mol2的文件头好像有电荷描述的部分,担心直接黏贴的情况会有什么不可知的影响。

没什么影响,复制粘贴没问题
按2L的做法可以更自动化
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Niohe    时间: 2022-4-13 11:29
谢谢回复。了解了。




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