计算化学公社
标题:
新手求助,使用Multiwfn脚本结合ORCA进行RESP计算的问题
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作者Author:
Niohe
时间:
2022-4-11 08:53
标题:
新手求助,使用Multiwfn脚本结合ORCA进行RESP计算的问题
网上找的Amber的教程多数都是使用Gaussian得到的out文件然后使用antechamber命令得到一个resp电荷的mol2文件。
antechamber -i ligand.out -fi gout -c resp -o ligand_resp.mol2 -fo mol2 -pf y
那么使用Multiwfn脚本通过ORCA计算得到的RESP电荷,是不是只要复制到mol2文件中对应位置得到resp的mol2文件就可以直接进行下一步生成输入文件frcmod文件导入到体系中去了?
谢谢
作者Author:
z9527567
时间:
2022-4-11 09:02
我感觉是的,其实也不用复制粘贴,用Multiwfn保存为pqr格式,然后openbabel转一下mol2就好了,复制粘贴怪麻烦的
作者Author:
Niohe
时间:
2022-4-11 10:53
谢谢,就是看到mol2的文件头好像有电荷描述的部分,担心直接黏贴的情况会有什么不可知的影响。
作者Author:
sobereva
时间:
2022-4-11 19:01
Niohe 发表于 2022-4-11 10:53
谢谢,就是看到mol2的文件头好像有电荷描述的部分,担心直接黏贴的情况会有什么不可知的影响。
没什么影响,复制粘贴没问题
按2L的做法可以更自动化
作者Author:
Niohe
时间:
2022-4-13 11:29
谢谢回复。了解了。
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