计算化学公社
标题:
Sobtop拓扑类型分类脚本
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作者Author:
EdwardLimit
时间:
2022-4-11 16:06
标题:
Sobtop拓扑类型分类脚本
各位老师好,小弟最近用sobtop生成了腐殖酸的itp文件,但发现拓扑类型并没有写出通用的形式,这样不方便进行更复杂分子的建模。例如下图中,只需知道每种Type的力场便可以知道这些Type随机排列组合为更大分子的力场。因此小弟写了一个脚本对生成通用形式拓扑类型的脚本
输入命令为: python code.py input.itp output.itp
希望能帮助有同样问题的朋友。
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