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标题: 求助使用gmx bar计算自由能时得出的曲线不平整其结果是正确的吗？ [打印本页]

作者
Author: yee 时间: 2022-4-12 16:33
标题: 求助使用gmx bar计算自由能时得出的曲线不平整其结果是正确的吗？
大家好
我在使用gmx bar计算一种物质溶剂化到另在液体中的自由能时，发现bar.xvg里画出的曲线是不平滑的，请问是lambda大小或者数量不合适的问题造成的吗，这对自由能计算结果会有影响吗？我计算得出结果与文献相差10%。
我计算的具体步骤是：先将溶剂npt，然后将其solavte到一个溶剂分子中，然后进行min、min2、nvt、npt、prd，通过先关闭库伦作用力lambda=0.1，然后关闭范德华力lambda=0.1，共21个lambda点计算自由能。以下是我的参数控制文件。
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作者
Author: yee 时间: 2022-4-16 15:16
求助

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