计算化学公社
标题:
请问用gromacs做PS/PA6/石墨烯体系跑NVT时出现Segmentation fault的问题如何解决?
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作者Author:
ttto
时间:
2022-4-14 21:41
标题:
请问用gromacs做PS/PA6/石墨烯体系跑NVT时出现Segmentation fault的问题如何解决?
本帖最后由 ttto 于 2022-4-14 21:39 编辑
老师和各位网友好,本体系选择的是尼龙6 PA6(6个单体共30个分子)和聚苯乙烯PS(10个单体30个分子)以及三片石墨烯构成的模型,已经用steep和cg跑了两次能量最小化,用NPT跑完了退火,跑完NPT的模型(图片如下),但是紧接着跑NVT的时候都会出现Segmentation fault的问题,以下是我的NVT的mdp文件和Segmentation fault的截图(图片如下)
作者Author:
sobereva
时间:
2022-4-15 03:58
没特殊理由就别做NVT
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