计算化学公社

标题: Turbomole error in gradient step (1) [打印本页]

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 16:21
标题: Turbomole error in gradient step (1)
OPTIMIZATION CYCLE 1
Wed Jun  6 14:10:24 CST 2018

OpenMP run-time library returned nthreads = 28

data group $actual step is not empty
due to the abend of ridft

this is only a subsequent error message
check reason for abend in the other output files ...

use the command  'actual -r'  to get rid of that
internal module stack:
------------------------
rdgrad
turbo_setup
========================

  CONTRL dead = actual step
rdgrad ended abnormally
error in gradient step (1)
算核壳优化，有1400多个原子，这是输出文件里的问题，需要修改什么。

作者
Author: scf 时间: 2022-4-15 16:35
试试actual -r看有什么提示吧。印象里turbomole如果遇到一些错误不清除的化，没法续算，可能data group $actual step is not empty提示actual文件夹里有一些错误信息
另外turbomole有一个论坛 https://forum.turbomole.org/

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 16:38

scf 发表于 2022-4-15 16:35
试试actual -r看有什么提示吧。印象里turbomole如果遇到一些错误不清除的化，没法续算，可能data group $ac ...

试了actual -r 后重新提交会提示mos损坏，再define后还是这个提示错误

作者
Author: scf 时间: 2022-4-15 16:39
删除mos，重新define呢？

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 16:40

scf 发表于 2022-4-15 16:39
删除mos，重新define呢？

就是把mos删除重新define的

作者
Author: scf 时间: 2022-4-15 16:41
那就不知道了。重新开一个文件夹，从坐标文件开始define一次，最初就有mos文件损坏信息吗？

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 16:45

scf 发表于 2022-4-15 16:41
那就不知道了。重新开一个文件夹，从坐标文件开始define一次，最初就有mos文件损坏信息吗？

那时候没有提示损坏，

作者
Author: scf 时间: 2022-4-15 16:46
本帖最后由 scf 于 2022-4-15 16:48 编辑

https://forum.turbomole.org/index.php?topic=711.0
有人遇到过类似出错提示，被建议并行设置
另外如果重开一个文件夹，做个单点，能正常结束吗？

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 17:38

scf 发表于 2022-4-15 16:46
https://forum.turbomole.org/index.php?topic=711.0
有人遇到过类似出错提示，被建议并行设置
另外如果 ...

之前原子数少的都优化好了，到这个原子数多的不行了，turbomole能跨节点并行？不行吧，不能跨节点并行

作者
Author: scf 时间: 2022-4-15 17:50
本帖最后由 scf 于 2022-4-15 17:52 编辑

一个节点上没有28核? Turbomole有MPI和SMP，http://www.cosmologic-services.d ... ntation/DOKse9.html
MPI应该可以跨节点，虽然我很久之前用的Turbomole，当时好像是SMP -.-

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 18:33

scf 发表于 2022-4-15 17:50
一个节点上没有28核? Turbomole有MPI和SMP，http://www.cosmologic-services.d ... ntation/DOKse9.html
M ...

解决啦，是核数问题

作者
Author: xiaozhai 时间: 2022-4-15 19:32

scf 发表于 2022-4-15 17:50
一个节点上没有28核? Turbomole有MPI和SMP，http://www.cosmologic-services.d ... ntation/DOKse9.html
M ...

应该是原子数太多，运行起来内存太小了，核数改小一点就跑起来了

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