计算化学公社

标题: Scan后做频率分析没有虚频 [打印本页]

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gnli    时间: 2022-4-15 22:55
标题: Scan后做频率分析没有虚频
本帖最后由 gnli 于 2022-4-15 23:00 编辑

大家好 我想找C=O加氢反应的过渡态(金属中心的氢原子加到C上,N上的氢加到O上)
1.先扫描了C-H键的距离,得到了如下扫描曲线。
2.然后取能量最高点做频率计算,却没有虚频。
3.然后又在峰附近用很小的步长继续做了一个scan 但是峰值附近的结构还是没有虚频。做了Mn和Fe两个金属的计算,其他计算也是同样方法,频率计算都正常。
比较了这个结构和其他几个的结构,键长非常接近。所以很纳闷。
请问这种情况原因是什么,求大神指点。



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zjxitcc    时间: 2022-4-15 23:25
(1)先确认是否波函数是否稳定、过渡金属上的自旋布居是否符合期望,以免收敛到了错误的波函数解上;
(2)柔性扫描最高点通常是合理的过渡态初始结构,做freq有个明显虚频,但这是经验规则,不是物理定律,少数体系违背经验规则是可以的。
作者
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gnli    时间: 2022-4-16 00:03
zjxitcc 发表于 2022-4-15 23:25
(1)先确认是否波函数是否稳定、过渡金属上的自旋布居是否符合期望,以免收敛到了错误的波函数解上;
(2 ...

做了scan峰值处结构的波函数稳定性测试:
#p stable 6-311+g(d,p) empiricaldispersion=gd3bj pbe1pbe
结果显示:“The wavefunction is stable under the perturbations considered.”

那请问出现这种非经验情况,应该怎么找到过渡态呢?
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dnlx    时间: 2022-4-16 11:09
这个协同反应的反应物和过渡态“没有局部带显著负电荷”(http://sobereva.com/119),是否需要去掉弥散函数试一下?
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gnli    时间: 2022-4-16 17:20
dnlx 发表于 2022-4-16 11:09
这个协同反应的反应物和过渡态“没有局部带显著负电荷”(http://sobereva.com/119),是否需要去掉弥散函 ...

不加弥散也不行,还是没有虚频
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dnlx    时间: 2022-4-16 19:13
gnli 发表于 2022-4-16 17:20
不加弥散也不行,还是没有虚频

如果是我的话,只能改用ORCA的NEB-TS去寻找过渡态。
作者
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gnli    时间: 2022-4-17 02:41
本帖最后由 gnli 于 2022-4-17 02:43 编辑

ORCA的话还得现学个软件。。。用 opt=(ts,calcfc,noeigen)的话总是跑回反应物了
我现在把scan导出来的结构用最慢的opt=(ts,calcall,noeigen) 继续优化看看情况






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