计算化学公社

标题: 求助：比较离子迁移速率可通过计算什么来比较呢？ [打印本页]

作者
Author: confidence 时间: 2022-4-18 17:10
标题: 求助：比较离子迁移速率可通过计算什么来比较呢？
各位老师好，我想用gmx来比较钠离子和氯离子在不同MXenes膜中的移动速率，请问可以通过计算什么来进行比较呢？

此外，MXenes的itp文件能否通过sobtop生成呢，采用何种力场较好呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-19 01:05
原理上Sobtop生成MXene的拓扑文件没问题，参考官网上产生FeCl2的例子。
至于参数，先去搜文献。如果没有合适的，LJ参数先用UFF的将就着（可以之后进一步调节）。原子电荷可以用REPEAT。对于bonded参数，图省事就先把体系当成刚性的。

作者
Author: confidence 时间: 2022-4-19 09:49

sobereva 发表于 2022-4-19 01:05
原理上Sobtop生成MXene的拓扑文件没问题，参考官网上产生FeCl2的例子。
至于参数，先去搜文献。如果没有合 ...

好的谢谢sob老师

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