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标题: ADMP分子动力学模拟单位问题求助 [打印本页]

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pfeng    时间: 2022-4-22 16:14
标题: ADMP分子动力学模拟单位问题求助
在用ADMP做分子动力学模拟的时候,高斯输出里轨迹的在某步的速度如下
Initial mass-weighed velocity (sqrt(amu)*bohr/sec) for trajectory
I=    1 X=  -3.349945930877D+13 Y=  -3.855226962077D+13 Z=   9.792787457118D+13
I=    2 X=   1.669955823089D+13 Y=   1.921839590099D+13 Z=  -1.574057289779D+13
I=    3 X=   8.711453647047D+12 Y=   1.002542478952D+13 Z=  -4.886116076843D+13
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TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ


请问这里的mass-weighed velocity (sqrt(amu)*bohr/sec)如何转换为直角坐标系的速度(m/s)?
因为要是带入电子质量 amu 和 波尔半径,这样得到的速度值太小了,有点不太可信。
求大佬释疑。。。


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wzkchem5    时间: 2022-4-22 16:36
mass-weighed velocity和速度的量纲不一样,前者是 (质量)^(1/2)*长度/时间 ,后者是 长度/时间 ,所以不能换算
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pfeng    时间: 2022-4-22 16:41
wzkchem5 发表于 2022-4-22 16:36
mass-weighed velocity和速度的量纲不一样,前者是 (质量)^(1/2)*长度/时间 ,后者是 长度/时间 ,所以不能 ...

那请问您,如何根据质量权重速度求相应原子的动能?m v^2 / 2 ? 直接带入质量权重速度吗?
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sobereva    时间: 2022-4-22 20:49
amu = atomic mass unit,不是电子质量
你先搞清楚质权速度是怎么来的,怎么引入的原子质量信息,自然就知道怎么反解出来常规单位的速度。




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