计算化学公社

标题: 使用pbs排队申请多块gpu，可不可以每一块gpu同时跑不同的任务？ [打印本页]

作者
Author: 尘劫 时间: 2022-4-24 16:37
标题: 使用pbs排队申请多块gpu，可不可以每一块gpu同时跑不同的任务？
我们学校有个集群，有gpu节点，使用的是pbs排队系统。我想在一个pbs脚本里面申请多块gpu，而且每块gpu同时跑不同的任务，请教一下可不可以实现这个功能，可以的话pbs脚本怎么写才可以实现？

作者
Author: abin 时间: 2022-4-24 17:36
可。具体看队列规则。

作者
Author: bluewhale 时间: 2022-4-25 09:50
通过 -t ，结合 PBS_ARRAYID，e.g.:
假定申请了4块GPU卡，
脚本头加上
#PBS -t 1-4
程序运行：
g16 mol-${PBS_ARRAYID}.com > mol-${PBS_ARRAYID}.log
细节到网上查一下。

作者
Author: 尘劫 时间: 2022-4-27 11:04

bluewhale 发表于 2022-4-25 09:50
通过 -t ，结合 PBS_ARRAYID，e.g.:
假定申请了4块GPU卡，
脚本头加上

不太懂，我想到了另一个方法，在要运行的命令行上一行指定gpu，CUDA_VISIBLE_DEVICES，同时在下一行命令前加上nohup挂起好像也可以实现这个效果，只不过这样最后一个命令不能加nohup，而且还要是运行时间最长的，不然每个命令行都nohup，提交完作业就停止了

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