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标题: 扩散系数与平衡密度在这种差异下能否对力场参数进行验证 [打印本页]

作者
Author: 五月雨 时间: 2022-4-24 22:10
标题: 扩散系数与平衡密度在这种差异下能否对力场参数进行验证
本帖最后由五月雨于 2022-5-17 16:24 编辑

   1、跑了一个纯MEA的模拟体系，在能量最小化之后首先进行了4ns的NPT，平衡密度和文献一致，之后进行了10ns的NVT。力场使用的是Amber03，文献（da Silva）中使用的是Amber，具体指哪个没提。MEA的拓扑文件是根据GAFF产生的，和文献相同。但是不知道为什么，itp文件中各种力常数和文献有不小的差异。

   最后得到平衡密度和文献一致，自扩散系数为0.41×10-5 cm2/s ，文献值（da Silva）为0.61×10-5 cm2/s，但是最后da Silva说考虑误差建议值在（0.61±0.3）×10-5 cm2/s。
   请问各位老师，0.41这个值可不可以接受，来证明力场参数的准确性？
                                       (, 下载次数 Times of downloads: 6)


   2、我在相同理论水平上进行了关于CO2的参数验证，模型选择的是EPM2，最终的得到的平衡密度为2.0kg/m3，实验值为1.624±0.10kg/m3；扩散系数为0.15 cm2/s ，实验为0.16 cm2/s。请问这个数据能不能作为力场参数的验证呢？

作者
Author: get-it 时间: 2022-4-25 03:44
直接问作者不好吗

作者
Author: 五月雨 时间: 2022-4-25 09:09

get-it 发表于 2022-4-25 03:44
直接问作者不好吗

好，我尝试一下

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