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标题: 通过Multiwfn进行AIM电子密度盆分析的结果与实际有出入 [打印本页]

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Author: fy_111 时间: 2022-4-25 20:48
标题: 通过Multiwfn进行AIM电子密度盆分析的结果与实际有出入
老师们好，我在使用Multiwfn进行AIM电子密度盆分析时发现所得的密度和实际有一些出入，以下是我的问题：
我分析的分子如下：
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其中，羰基的氧电子密度为9.157，符合普遍认为的羰基中的氧电负性大于碳，存在吸电子的诱导效应以及吸电子的共轭效应，因为电子密度偏高；但是其余两个氧，按有机化学所学的应该是给电子的共轭效应大于吸电子的诱导效应，因此电子密度应该是偏低的，但是计算结果分别为9.164和9.167，所以无法理解为什么理论分析结果是这样的，望做过这方面分析的老师帮忙解答一下，谢谢！

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Author: wzkchem5 时间: 2022-4-25 21:00
AIM本来结果就经常不符合化学规律，它的主要好处在于结果是well-defined的，随着基组增大结果趋于一个固定值，而且可以适用于任何电子密度，但是它为了满足这些性质而牺牲了物理意义，导致计算结果经常很难用来解释实验规律。所以如果没有特殊原因，不要用AIM，应该改用Hirshfeld、NPA等布居分析

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Author: fy_111 时间: 2022-4-25 22:09

wzkchem5 发表于 2022-4-25 21:00
AIM本来结果就经常不符合化学规律，它的主要好处在于结果是well-defined的，随着基组增大结果趋于一个固定 ...

因为需要用到定量分析不同位点的电子密度，所以试了一下AIM。老师说的其余两种方法我还不是很了解，我再研究一下；本来想通过静电势来分析的，但是静电势对于不同位点比较小的电子密度的差别好像不能很好的表示（等值面颜色接近），所以本来打算结合静电势等值面图和AIM定量的电子密度值进行分析，但目前来看好像行不通了

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Author: sobereva 时间: 2022-4-26 07:21
不得24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里同一问题，注意看群文件里群规，以及论坛置顶的论坛新社员必读贴

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同一个问题多处问纯属给别人添乱

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Author: sobereva 时间: 2022-4-26 07:25

fy_111 发表于 2022-4-25 22:09
因为需要用到定量分析不同位点的电子密度，所以试了一下AIM。老师说的其余两种方法我还不是很了解，我再 ...

好好把《原子电荷计算方法的对比》（http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml）仔细看了了解原子电荷的基本常识
没事甭用又贵又烂的AIM电荷

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Author: fy_111 时间: 2022-4-26 09:31

sobereva 发表于 2022-4-26 07:21
不得24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里同一问题，注意看群文件里群规，以及论坛置顶的论坛新 ...

嗯嗯，以后一定注意，谢谢老师提醒。

作者
Author: fy_111 时间: 2022-4-26 09:32

sobereva 发表于 2022-4-26 07:25
好好把《原子电荷计算方法的对比》（http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml）仔细 ...

嗯嗯，这就看一下，谢谢sob老师。

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Author: fy_111 时间: 2022-4-26 14:38

sobereva 发表于 2022-4-26 07:25
好好把《原子电荷计算方法的对比》（http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml）仔细 ...

老师，我后面采用ADCH方法进行的分析，这个综合来看是符合常识的，但是圈出来的那个C原子所带的负电荷比羰基上的氧都多，这一点是不是存在一些问题呢？这种问题一般通过什么方式解决比较好呢？目前我在尝试用大基组计算，之前用的是PBE0/6-31G(d,p)。 (, 下载次数 Times of downloads: 17) (, 下载次数 Times of downloads: 13)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-27 05:13

fy_111 发表于 2022-4-26 14:38
老师，我后面采用ADCH方法进行的分析，这个综合来看是符合常识的，但是圈出来的那个C原子所带的负电荷比 ...

《原子电荷计算方法的对比》的测试明显体现了ADCH对基组敏感性很低，用更大的基组毫无意义

可尝试其它原子电荷计算方法

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Author: fy_111 时间: 2022-4-27 10:00
本帖最后由 fy_111 于 2022-4-27 19:58 编辑

sobereva 发表于 2022-4-27 05:13
《原子电荷计算方法的对比》的测试明显体现了ADCH对基组敏感性很低，用更大的基组毫无意义

可尝试其它 ...

是的，我也有看到文章里这个基组对比图。但后面我尝试了PBE0/6-311G(d,p)之后，这两个原子电荷差值变小了（碳的负电荷减少，氧的基本不变），后面又试了一下老师在文章里提到的b3lyp/cc-pvtz，此时电荷值和PBE0/6-311G(d,p)相比并未有太大变化。所以现在我的疑惑变成了这个碳是否就应该是带有比较多的负电荷呢？
今天我会再学习一下如何用NPA方法计算，再来对比看一下。

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Author: fy_111 时间: 2022-4-28 00:50

sobereva 发表于 2022-4-27 05:13
《原子电荷计算方法的对比》的测试明显体现了ADCH对基组敏感性很低，用更大的基组毫无意义

可尝试其它 ...

然后又用了becke电荷表示了一下，发现校正前的电荷值比较满意，不知道校正前的数据是否可以使用呢？（上图为becke电荷，下图为ADCH电荷） (, 下载次数 Times of downloads: 19)

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Author: sobereva 时间: 2022-4-28 05:12

fy_111 发表于 2022-4-28 00:50
然后又用了becke电荷表示了一下，发现校正前的电荷值比较满意，不知道校正前的数据是否可以使用呢？（上 ...

不建议用Becke电荷，不是流行的方法。Hirshfeld电荷流行得多

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