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标题: VMD合并多个ADNDP轨道的cube [打印本页]

作者
Author: 菜还不想动 时间: 2022-4-26 15:23
标题: VMD合并多个ADNDP轨道的cube
看了卢老师的博文《使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键》，可以绘制出了单个的AdNDP轨道，在VMD中使用Multiwfn程序包里的examples\AdNDP\plotAdNDP.vmd是写的VMD脚本，但是要同时绘制多个轨道，这里set name后面的路径应该怎么写？
#0 blue, 1 red, 2 gray, 3 orange, 4 yellow, 5 tan, 6 silver, 7 green, 8 white, 9 pink, 10 cyan, 11 purple
set posclr 4
set negclr 5
set istart 1
set iend 26
set isoval 0.06
set idinit 1

color Display Background white
display depthcue off
display rendermode GLSL
for {set i $istart} {$i<=$iend} {incr i 1} {
set idx [format %04d $i]
set name "F:\\gaussian\\B39\\AdNDPorb0001.cub"
puts Loading\ $name
mol new $name type {cube}
mol modstyle 0 $idinit Isosurface $isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 0 $idinit ColorID $posclr
mol modmaterial 0 $idinit Transparent
mol addrep $idinit
mol modstyle 1 $idinit Isosurface -$isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 1 $idinit ColorID $negclr
mol modmaterial 1 $idinit Transparent
incr idinit 1
}

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-27 05:42
博文里都写得如此明白了，说清楚哪里不懂

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仅仅是把我脚本里的例子的目录替换一下而已，事情就这么简单，要有最基本的举一反三的能力
(, 下载次数 Times of downloads: 5)

作者
Author: 菜还不想动 时间: 2022-4-27 08:47

sobereva 发表于 2022-4-27 05:42
博文里都写得如此明白了，说清楚哪里不懂

我明白了，谢谢老师

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