计算化学公社

标题: 求助大体系计算吉布斯自由能的程序推荐 [打印本页]

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Author: 不是兔纸不是猫 时间: 2022-4-26 17:01
标题: 求助大体系计算吉布斯自由能的程序推荐
请教老师和同学们，我现在要计算一个大约接近900个原子的金属团簇，就是金属外包裹一圈配体，类似于MOF那种结构，如下图，然后要计算吉布斯自由能，然后我看了下社长的教材是做几何优化然后振动分析就可得到。但现在的问题是我的体系太大了，量化程序感觉算不动，想恳请大家指点应该用什么软件速度比较快能尽快得到结果

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-4-26 17:24
用ORCA做ONIOM计算，金属以及和金属配位的原子用DFT，外面的取代基用xTB

作者
Author: rpestana94 时间: 2022-4-26 22:18
Try first using XTB for an opt then try with ORCA

作者
Author: lao7 时间: 2022-4-27 03:23
这么大还是分子动力学吧其他理论可行但是实际操作起来特费劲而且很容易报错

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-27 05:55
应当明确计算吉布斯自由能的目的是什么，很可能有明显更好的办法比起暴力算当前体系的自由能更能达到你的实际目的

作者
Author: 不是兔纸不是猫 时间: 2022-4-27 14:29
本帖最后由不是兔纸不是猫于 2022-4-27 15:07 编辑

sobereva 发表于 2022-4-27 05:55
应当明确计算吉布斯自由能的目的是什么，很可能有明显更好的办法比起暴力算当前体系的自由能更能达到你的实 ...

社长，合作者是想看反应方向和难易程度，然后他看的文献中的就是算如下图，我把文献也附在下边了，感谢社长
Molecular “surgery” on a 23-gold-atom nanoparticlehttps://www.science.org/doi/full/10.1126/sciadv.1603193
社长我图片和附件传不上来，只好附链接了，里边的Fig5是合作者想要的，谢谢社长

作者
Author: 不是兔纸不是猫 时间: 2022-4-27 14:32
我过一会再上传看看，传不上来

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-28 05:13

不是兔纸不是猫发表于 2022-4-27 14:32
我过一会再上传看看，传不上来

仔细看置顶的新社员必读贴了解上传图片的方式和要求

作者
Author: sobereva 时间: 2022-4-28 05:14

不是兔纸不是猫发表于 2022-4-27 14:29
社长，合作者是想看反应方向和难易程度，然后他看的文献中的就是算如下图，我把文献也附在下边了，感谢社 ...

考虑对结构简化
诸如没多大用处的基团直接砍掉，稍微有点保留价值的考虑用较小的基组，等等。别愣算

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Author: Will111 时间: 2022-7-18 08:55
好奇楼主里提到的社长的教材是什么？

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Author: sobereva 时间: 2022-7-26 06:41

Will111 发表于 2022-7-18 08:55
好奇楼主里提到的社长的教材是什么？

科音的量化培训班的讲义

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