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标题: 求助：使用MMPBSA对复合物的残基进行结合自由能的分解 [打印本页]

作者
Author: 阿志 时间: 2022-4-28 15:01
标题: 求助：使用MMPBSA对复合物的残基进行结合自由能的分解
我在一篇文献中看到amber可以计算结合自由能，也可以对结合自由能进行分解，而且是对关键氨基酸进行能量分解（类似于这个图片），我想问一下，这个应该如何实现？

作者
Author: Frozen-Penguin 时间: 2022-4-28 17:47
好像是要在输入文件里设置idecomp和print_res，具体内容见amber手册，36.3. Running MMPBSA.py，&decomp namelist variables

作者
Author: 阿志 时间: 2022-5-2 08:16

Frozen-Penguin 发表于 2022-4-28 17:47
好像是要在输入文件里设置idecomp和print_res，具体内容见amber手册，36.3. Running MMPBSA.py，&decomp na ...

好的，谢谢

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