计算化学公社

标题: 帮忙找一个势能面,谢谢 [打印本页]

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小范范1989    时间: 2016-3-26 19:17
标题: 帮忙找一个势能面,谢谢
我是做有机分子计算的,现在我想做一个TOC,想要一个势能面,不知道谁有这样的图片。
类似于sob老师的这个势能面。
我想要的是:上面的这个平面有两个凹的。下面这个平面能用颜色反映出来这个有两个凹的。
因为我计算了一个分子,找到了两个结构,一维曲线如下,我想要个三维的。
哎呀,不知道我描述的清楚不,希望大神能帮忙给我弄个这样的图片,谢谢了。

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冰释之川    时间: 2016-3-26 21:00
本帖最后由 冰释之川 于 2016-3-26 21:05 编辑

sob老师这个图不是势能面呀……亲
Seen Manual_3.3.9(dev) of 《Multiwfn》, P216-217 Shaded surface map with projection of localized orbital locator in a plane of monofluoroethane


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liyuanhe211    时间: 2016-3-27 00:57
你再扫描另一个维度(如另一根键长)不就是三维的了。怎么可能根据二维数据画三维图。瞎画一个那是编造数据。

以及这图形明显不是势能面
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mol    时间: 2016-3-27 11:18
三维的话需要扫描两个坐标同时变化,得到xyz数据后导入orgin,转换成matrix,然后就可以做contour图了
作者
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小范范1989    时间: 2016-3-27 11:22
mol 发表于 2016-3-27 11:18
三维的话需要扫描两个坐标同时变化,得到xyz数据后导入orgin,转换成matrix,然后就可以做contour图了

恩,好的,谢谢
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小范范1989    时间: 2016-3-27 11:22
liyuanhe211 发表于 2016-3-27 00:57
你再扫描另一个维度(如另一根键长)不就是三维的了。怎么可能根据二维数据画三维图。瞎画一个那是编造数据 ...

谢谢指点
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小范范1989    时间: 2016-3-27 11:23
冰释之川 发表于 2016-3-26 21:00
sob老师这个图不是势能面呀……亲
Seen Manual_3.3.9(dev) of 《Multiwfn》, P216-217  Shaded surface ma ...

恩,对,你说的对。我看这个这个很好看,所以想弄个类似的。
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sobereva    时间: 2016-4-3 12:53
H-H     H   -> H    H-H这个氢交换反应的势能面就是你要的那种,网上搜搜就有,实在不行自己scan一个也不麻烦




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