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标题: ALIE分析具有不同取代基的有机分子的亲电攻击差异性 [打印本页]

作者
Author: poseidonok 时间: 2022-5-3 21:25
标题: ALIE分析具有不同取代基的有机分子的亲电攻击差异性
老师们好！看了社长写的《使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用》，按照步骤尝试着计算了一系列具有不同取代基的分子的ALIE，希望通过比较ALIE值高低来预测不同分子发生亲电反应的可能性大小，产生了几个疑问，希望老师们解答！谢谢~
疑问1：如果两个分子间只是个别取代基有差异(如对氯苯酚、对硝基苯酚），整体构型差异不大，能否用ALIE值高低衡量两个分子发生亲电反应的可能性大小？
疑问2：如果上述分析合理的话，对于构型差异很大的两个分子（如苯酚和环丙烷），能否用ALIE值高低衡量两个分子发生亲电反应的可能性大小？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-4 10:39
1 可以。但能算势垒的时候还是应当算势垒作为绝对判断标准。
2 不可靠。ALIE主要是用于判断反应位点。虽然其绝对数值在不同分子间也能比，但其它因素对反应的可能性（假设用反应势垒来衡量）影响往往更大，而这不是光靠ALIE的数值能充分体现、区分的。

作者
Author: poseidonok 时间: 2022-5-4 11:14

sobereva 发表于 2022-5-4 10:39
1 可以。但能算势垒的时候还是应当算势垒作为绝对判断标准。
2 不可靠。ALIE主要是用于判断反应位点。虽然 ...

谢谢sob老师！我明白了。此外，还有一个找ALIE极小值点的问题，希望您能解答我的困惑。我使用vmd找极小值点，已调整为正交模式，有两个极值点在O=S=O处（如图1-3），但是我旋转了几个角度无法分清极小值点在氧原子上还是S=O键上，请问sob老师有没有什么好的方法分辨立体分子的极值点？我旋转了一个角度，发现这两个极值点可以分别向两个S=O键作垂线（图3），因此猜测这两个极值点是属于S=O键的，请问这种方法适用其他立体分子吗？
C:\Users\surui\Desktop

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-5 09:04

poseidonok 发表于 2022-5-4 11:14
谢谢sob老师！我明白了。此外，还有一个找ALIE极小值点的问题，希望您能解答我的困惑。我使用vmd找极小值 ...

不要考虑得过于教条、刻板
怎么考虑当前的结果、怎么用于解释化学问题，要结合具体问题

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