计算化学公社

标题: gaussian计算电解液中单个溶剂分子与离子之间结合能求助 [打印本页]

作者
Author: yangzhanlin 时间: 2022-5-4 17:54
标题: gaussian计算电解液中单个溶剂分子与离子之间结合能求助
各位老师，我现在想用gaussian计算1M LiFSI/DME 电解液中，单个溶剂分子DME与Li离子之间的结合能，具体计算流程是要怎么实现？感谢老师解惑！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-5 08:30
最糙的做法，结合Li+的DME的能量减去Li+的能量再减去DME的能量，复合物和DME分别优化。优化和能量计算都在隐式溶剂模型下进行

然而靠隐式溶剂模型没法把Li+在DME中的状态描述得较准确，对精度有一定要求的情况下应当考虑显式溶剂

作者
Author: yangzhanlin 时间: 2022-5-5 10:09

sobereva 发表于 2022-5-5 08:30
最糙的做法，结合Li+的DME的能量减去Li+的能量再减去DME的能量，复合物和DME分别优化。优化和能量计算都在 ...

谢谢老师的解答，那在做锂离子，DME，和Li+DME优化时，是否都要在溶剂环境下？溶剂模型是都要用DME吗？

作者
Author: 付之一生 时间: 2022-5-5 14:37

yangzhanlin 发表于 2022-5-5 10:09
谢谢老师的解答，那在做锂离子，DME，和Li+DME优化时，是否都要在溶剂环境下？溶剂模型是都要用DME吗？

兄弟，你为什么只需要考虑一个溶剂分子呢，锂不是四配位吗

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-5 20:18

yangzhanlin 发表于 2022-5-5 10:09
谢谢老师的解答，那在做锂离子，DME，和Li+DME优化时，是否都要在溶剂环境下？溶剂模型是都要用DME吗？

Li+根本没法优化
DME本身不需要非得在溶剂模型下优化，但为了统一，DME和Li+DME都在溶剂模型下优化。
但这么计算虽然省事但实在不准，没多大实际意义。

我建议你把真空下计算的[Li(DME)n-1]+ + DME -> [Li(DME)n]+的能量变化当做你要求的结合能。其中[Li(DME)n]+可以用genmer+molclus做构型搜索得到，看《genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具》（http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html）和molclus主页（http://www.keinsci.com/research/molclus.html）里的相关信息；也可以给Li+周围包上一层DME然后用xtb在GFN-xTB级别下跑动力学产生一批初始结构，然后再用molclus优化和筛选出能量最低的Li(DME)n构型。

作者
Author: yangzhanlin 时间: 2022-5-8 15:22

sobereva 发表于 2022-5-5 20:18
Li+根本没法优化
DME本身不需要非得在溶剂模型下优化，但为了统一，DME和Li+DME都在溶剂模型下优化。
...

好的，谢谢老师的解答

作者
Author: yangzhanlin 时间: 2022-5-8 15:24

付之一生发表于 2022-5-5 14:37
兄弟，你为什么只需要考虑一个溶剂分子呢，锂不是四配位吗

我是看文献中是这么做的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-8 15:47

yangzhanlin 发表于 2022-5-8 08:24
我是看文献中是这么做的

文献研究的是溶液相还是气相？有的时候文献可能研究的是气相团簇，也就是气相里一个裸露的Li+和一个DME分子的结合，此时如果你要研究电解液就不能简单照搬文献的做法。

作者
Author: 付之一生 时间: 2022-5-14 21:04

yangzhanlin 发表于 2022-5-8 15:24
我是看文献中是这么做的

兄弟，能留个联系方式吗

作者
Author: 付之一生 时间: 2022-5-28 16:24

sobereva 发表于 2022-5-5 20:18
Li+根本没法优化
DME本身不需要非得在溶剂模型下优化，但为了统一，DME和Li+DME都在溶剂模型下优化。
...

老师，这个包一层DMF是什么意思，是建模的时候随机在Li+周围填满dmf吗

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-30 05:42

付之一生发表于 2022-5-28 16:24
老师，这个包一层DMF是什么意思，是建模的时候随机在Li+周围填满dmf吗

是

作者
Author: 飒小飒 时间: 2023-2-28 23:06
道友，方便留个联系方式嘛，

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