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标题: 求助：有没有一些网站可以快速找到构建小分子的虚拟点所带电荷？ [打印本页]

作者
Author: 风起于夏 时间: 2022-5-5 19:03
标题: 求助：有没有一些网站可以快速找到构建小分子的虚拟点所带电荷？
各位老师，我对小分子的构建不太会处理，之前一直认为构建氢分子，就只需要建好两个氢原子，再连接就好了，但是在gromacs中进行弛豫它的密度就会无限增大，后来了解到了虚拟位点，才解决了这一问题。但是在找虚拟点应该赋予多少电荷，氢原子有多重的文献花了很长时间。现在想请教各位老师有没有一种网站能够快速的解决这个问题。顺便想请教一下MS中构建小分子也能用这种方法吗？又如何使用呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-6 13:25
Multiwfn做拟合静电势电荷计算的时候可以加上不在原子电荷上的拟合中心，通过此做法可以确定比较合适的虚拟点的电荷值（但虚拟点的位置设在哪有任意性，可以做测试来决定最佳的），参看下文
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）

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