计算化学公社

标题: 请教合金吸附的一点问题 [打印本页]

作者
Author: 萧瑟 时间: 2022-5-6 16:16
标题: 请教合金吸附的一点问题
课题组的计算资源非常有限，加上自己也是初学者所以对于现在的体系也只能计算合金吸附小分子的差分电荷以及吸附能的变化。（服务器太小DOS 实在算不动因为版权问题只能用免费的CP2K计算）
现在得到的结果是掺杂形成合金之后原来的吸附位点上的原子与小分子之间的转移电子数明显减少了，并且计算了形成合金之后的吸附能也相应的降低了一点。
对于现有的这两个结果（通过差分电荷也可以看出掺杂的原子对原本的金属原子有较强的吸电子作用），能否说明是因为吸附位点上的金属原子的d带中心下降所导致的吸附能减小？
除了直接算DOS 还有没有其他的数据可以间接说明d带中心的变化？非常感谢各位老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-6 18:54
需要给出体系具体截图，让别人能看出来吸附的机理是什么，到底前后差异在于什么元素，否则没法准确回答

d带中心就是靠PDOS体现的，没有什么其它靠谱的方法展现。当前问题和d带变化未必有什么直接关系，对体系特征一无所知的情况下猜着回答根本不靠谱

作者
Author: 萧瑟 时间: 2022-5-6 20:06

sobereva 发表于 2022-5-6 18:54
需要给出体系具体截图，让别人能看出来吸附的机理是什么，到底前后差异在于什么元素，否则没法准确回答

...

sob老师不知道为什么png格式的图片没有超过9.8Mb 但是就是上传不了。
最直观来说
1. 吸附位点的原子是会向小分子转移部分电子按照sob老师的博文对照着操作选定固体与小分子之间为节面节面以下电荷位移积分为负，固体总体电荷减少了。
2. 在相同的等值面下，差分电荷密度可以直观的看到内层掺杂的原子对表层的吸附位点原子的电子云为正的体积更大一些，表明了掺杂的异种金属原子对原金属是吸电子的作用。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-7 09:41

萧瑟发表于 2022-5-6 20:06
sob老师不知道为什么png格式的图片没有超过9.8Mb 但是就是上传不了。
最直观来说
1. 吸附位点的原 ...

仔细看置顶的社员必读贴，怎么可能允许用户上传单张png高达9.8MB的图片，还不得造成一些对图像处理没有基本常识的用户上传巨大图片极度浪费论坛资源
搞清楚附件尺寸的限制和图片尺寸的限制

贴图说事，没法猜着回答

作者
Author: 萧瑟 时间: 2022-5-7 10:15

sobereva 发表于 2022-5-7 09:41
仔细看置顶的社员必读贴，怎么可能允许用户上传单张png高达9.8MB的图片，还不得造成一些对图像处理没有基 ...

sob老师我打了个包您帮我看看吧

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-7 15:47

萧瑟发表于 2022-5-7 10:15
sob老师我打了个包您帮我看看吧

直接贴图，别当附件发。附件已删除

作者
Author: 萧瑟 时间: 2022-5-7 15:52
本帖最后由萧瑟于 2022-5-11 18:22 编辑

sobereva 发表于 2022-5-7 15:47
直接贴图，别当附件发。附件已删除

好了 sob老师您看看吧

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-9 21:59

萧瑟发表于 2022-5-7 15:52
好了 sob老师您看看吧

标明各个颜色原子都是什么元素

作者
Author: 萧瑟 时间: 2022-5-9 22:00

sobereva 发表于 2022-5-9 21:59
标明各个颜色原子都是什么元素

青色的是Pd 蓝色的是Ir

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-11 21:17
CO和两个Pd都有成键作用，但和Ir看上去基本没怎么成键，因而吸附到纯Pd上电子转移量更大、吸附能也更大

CP2K能算单点就能产生molden文件（看下文）
使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用
http://sobereva.com/588（http://bbs.keinsci.com/thread-21742-1-1.html）

之后用Multiwfn按下文对纯Pd，以及对合金里Pd和Ir各自部分绘制d的PDOS，从而看d带中心，不花什么时间
用Multiwfn计算过渡金属的d-band center（d带中心）
http://sobereva.com/582（http://bbs.keinsci.com/thread-21295-1-1.html）

作者
Author: 萧瑟 时间: 2022-5-11 21:48

sobereva 发表于 2022-5-11 21:17
CO和两个Pd都有成键作用，但和Ir看上去基本没怎么成键，因而吸附到纯Pd上电子转移量更大、吸附能也更大

...

好的sob老师，非常感谢

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)