计算化学公社

标题: 求助:1、使用npt系综时,log文件里lxlylz一直保持相等;2、vmd里看到有的键被拉长 [打印本页]

作者
Author:
等天黑    时间: 2022-5-7 10:34
标题: 求助:1、使用npt系综时,log文件里lxlylz一直保持相等;2、vmd里看到有的键被拉长
1:npt系综,盒子的体积是在变得,奇怪的是盒子的lxlylz一直是相等的。如下:
Step Temp Press Volume Lx Ly Lz
  100993    1586.2004   -79.451599    166247.42    54.985938    54.985938    54.985938
  101000    1590.5118   -306.48246    166245.63     54.98574     54.98574     54.98574
  102000    1622.6676    429.53905    166142.63    54.974383    54.974383    54.974383
  103000    1600.2141    214.70499    165876.78    54.945045    54.945045    54.945045
  104000    1596.2106    390.01874    164182.63    54.757347    54.757347    54.757347
  105000    1614.0762   -108.36084    164264.76    54.766477    54.766477    54.766477
  106000     1600.185    810.77693    164767.31     54.82227     54.82227     54.82227
  107000    1551.3933    270.10661    162879.68    54.612111    54.612111    54.612111
  108000    1571.2216   -364.91488    166112.88    54.971101    54.971101    54.971101
  109000    1562.9856   -103.86794    163065.97    54.632924    54.632924    54.632924
  110000    1558.7031   -274.87518    165320.47    54.883552    54.883552    54.883552
  111000    1534.7384   -87.082604    164282.25    54.768421    54.768421    54.768421
  112000    1561.7068    -157.5026    164242.69    54.764024    54.764024    54.764024
  113000    1546.0862   -15.212629    162407.35    54.559271    54.559271    54.559271
  114000    1538.0988   -242.15939    163821.91    54.717216    54.717216    54.717216

轨迹文件显示在npt的过程中,有两个键一直被拉长。如图: (, 下载次数 Times of downloads: 11) (, 下载次数 Times of downloads: 20) (, 下载次数 Times of downloads: 17)

这个颗粒是sio2,按道理来说这两个键和其余的键是同一类键,且键参数是一样的。 可是不知道为什么只有这两个键不太一样

本人学习lammps时间不长,跪求各位大佬帮忙指点!!





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3