计算化学公社

标题: 手上只有pdb文件，怎么通过Multiwfn计算RESP [打印本页]

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Author: ASL-D 时间: 2022-5-7 16:05
标题: 手上只有pdb文件，怎么通过Multiwfn计算RESP
手上只有pdb文件，怎么通过Multiwfn计算RESP

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Author: 牧生 时间: 2022-5-7 16:10
本帖最后由牧生于 2022-5-7 16:11 编辑

http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html

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Author: ASL-D 时间: 2022-5-7 16:17

牧生发表于 2022-5-7 16:10
http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html

你好，只有通过Linux上才可以吗？我通过windows上的Multiwfn7——18，报错没有波函数信息

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Author: snljty 时间: 2022-5-7 16:49

ASL-D 发表于 2022-5-7 16:17
你好，只有通过Linux上才可以吗？我通过windows上的Multiwfn7——18，报错没有波函数信息

你得先做单点计算得到波函数，不管用Gaussian还是别的什么量化程序。直接用pdb当然不行。认真看卢老师博文详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换和RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算还有RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算

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Author: ASL-D 时间: 2022-5-7 16:58

snljty 发表于 2022-5-7 16:49
你得先做单点计算得到波函数，不管用Gaussian还是别的什么量化程序。直接用pdb当然不行。认真看卢老师博 ...

哦哦，谢谢老师

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Author: sobereva 时间: 2022-5-8 09:29
恰当安装Gaussian或ORCA，恰当安装Multiwfn，用下文的脚本直接就算出来了，没法更简单
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果）
http://sobereva.com/476（http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html）
ORCA结合Multiwfn计算RESP、RESP2和1.2*CM5原子电荷的懒人脚本
http://sobereva.com/637（http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html）

Windows的机子可以装vmware虚拟机跑linux运行上面的脚本。

倘若你自己手动载入文件用主功能7的子功能18算RESP电荷，显然载入的文件必须有波函数信息才能算，仔细看
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html）
而且这在下文里都极为明确说了
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）

使用这两个模块要求Multiwfn的输入文件里包含波函数信息，更确切来说，是至少包含GTF信息。哪些输入文件包含GTF信息，看过《详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换》（http://sobereva.com/379）就自然明白了。量子化学程序产生的诸如.wfn、.wfx、.fch、.gms、.molden等格式的文件都可以作为输入文件。

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