计算化学公社

标题: 请问如何生成超胞外包裹一层溶剂分子的结构？ [打印本页]

作者
Author: UTM 时间: 2022-5-9 19:34
标题: 请问如何生成超胞外包裹一层溶剂分子的结构？
请问各位老师和同学，我想在构造好的超胞外面包裹一层溶剂分子，溶剂分子的个数由我自己设置。但是使用solvate命令会让溶剂分子填充到超胞结构中，这个该如何解决？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-9 20:55
把产生的结构载入VMD，保存新结构的时候用恰当的选择语句把不想要的地方的溶剂排除掉
参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

作者
Author: UTM 时间: 2022-5-9 21:05

sobereva 发表于 2022-5-9 20:55
把产生的结构载入VMD，保存新结构的时候用恰当的选择语句把不想要的地方的溶剂排除掉
参考
VMD里原子选择 ...

好的，谢谢sob老师，我去研究一下。

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